More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0202 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  100 
 
 
175 aa  348  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  75.43 
 
 
175 aa  287  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  71.84 
 
 
175 aa  277  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  81.03 
 
 
175 aa  268  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  68.39 
 
 
174 aa  261  4.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  66.86 
 
 
175 aa  258  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  67.98 
 
 
178 aa  256  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  67.23 
 
 
177 aa  246  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  62.71 
 
 
181 aa  242  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  63.43 
 
 
203 aa  242  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  68.02 
 
 
176 aa  241  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  60.47 
 
 
187 aa  236  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  63.1 
 
 
188 aa  236  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  61.05 
 
 
194 aa  235  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  60.47 
 
 
194 aa  234  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  61.36 
 
 
182 aa  228  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  61.36 
 
 
182 aa  228  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  63.74 
 
 
172 aa  228  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  68.93 
 
 
177 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  60.8 
 
 
182 aa  225  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  68.93 
 
 
177 aa  224  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  63.74 
 
 
177 aa  224  7e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  58.96 
 
 
174 aa  222  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  68.93 
 
 
177 aa  221  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  68.93 
 
 
177 aa  221  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  68.93 
 
 
177 aa  221  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  68.93 
 
 
177 aa  221  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  68.93 
 
 
177 aa  221  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  68.93 
 
 
177 aa  221  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  68.93 
 
 
177 aa  221  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  68.93 
 
 
177 aa  221  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  68.36 
 
 
177 aa  221  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  58.48 
 
 
201 aa  216  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  56.65 
 
 
177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  56.07 
 
 
177 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  56.65 
 
 
177 aa  211  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  55.37 
 
 
177 aa  205  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  58.48 
 
 
173 aa  204  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  58.48 
 
 
173 aa  204  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  54.29 
 
 
181 aa  202  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  56.82 
 
 
176 aa  199  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  50.57 
 
 
180 aa  198  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  53.93 
 
 
178 aa  197  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  52.84 
 
 
175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  54.86 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  53.71 
 
 
175 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  53.71 
 
 
175 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  52 
 
 
175 aa  193  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  52 
 
 
175 aa  193  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  51.65 
 
 
273 aa  193  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  50.82 
 
 
266 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 
177 aa  191  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  51.43 
 
 
175 aa  191  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  51.43 
 
 
175 aa  191  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  48.09 
 
 
250 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  53.37 
 
 
178 aa  190  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  50 
 
 
265 aa  190  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  53.45 
 
 
188 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  50.55 
 
 
185 aa  189  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  48.17 
 
 
198 aa  189  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  50.54 
 
 
306 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  55.36 
 
 
172 aa  189  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  52.27 
 
 
177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  53.18 
 
 
202 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  49.16 
 
 
266 aa  188  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  48.86 
 
 
176 aa  188  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  52.87 
 
 
192 aa  187  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  48.86 
 
 
243 aa  187  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  49.73 
 
 
273 aa  187  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  47.7 
 
 
185 aa  187  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  54.29 
 
 
183 aa  187  8e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  52.02 
 
 
199 aa  186  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  50 
 
 
177 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  51.43 
 
 
273 aa  185  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  50.87 
 
 
198 aa  185  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  52 
 
 
277 aa  184  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  53.07 
 
 
228 aa  184  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  49.71 
 
 
199 aa  184  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  50.56 
 
 
179 aa  184  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  50.56 
 
 
179 aa  184  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  50.56 
 
 
179 aa  184  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  50.87 
 
 
203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  50.56 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  47.16 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  47.16 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  47.73 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  51.96 
 
 
242 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  51.96 
 
 
242 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 
177 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  46.02 
 
 
176 aa  181  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 
193 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 
193 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  51.12 
 
 
176 aa  182  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  48.3 
 
 
176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 
185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  49.72 
 
 
177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  47.16 
 
 
176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  47.98 
 
 
196 aa  181  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  46.59 
 
 
176 aa  181  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  47.16 
 
 
176 aa  181  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.16997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>