More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0199 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  78 
 
 
400 aa  639    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  80 
 
 
396 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  82.75 
 
 
400 aa  702    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  80 
 
 
396 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  81 
 
 
397 aa  649    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  81 
 
 
397 aa  649    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0177  elongation factor Tu  83.5 
 
 
400 aa  677    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000229884  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  100 
 
 
400 aa  818    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  90 
 
 
400 aa  751    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0192  elongation factor Tu  83.5 
 
 
400 aa  677    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174926  normal  0.0285704 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  82.16 
 
 
400 aa  689    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  82.16 
 
 
400 aa  689    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0686  elongation factor Tu  80 
 
 
399 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0699  elongation factor Tu  80.5 
 
 
399 aa  643    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  85 
 
 
400 aa  706    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  80 
 
 
396 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  82.41 
 
 
395 aa  673    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  90.2 
 
 
400 aa  749    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  83.75 
 
 
400 aa  704    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  83.75 
 
 
400 aa  703    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  82.96 
 
 
399 aa  692    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  100 
 
 
400 aa  818    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  83.21 
 
 
400 aa  694    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  80 
 
 
396 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  78.5 
 
 
400 aa  639    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  83.5 
 
 
400 aa  705    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  83.5 
 
 
400 aa  704    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  76.25 
 
 
397 aa  629  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  77.75 
 
 
396 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  76.5 
 
 
397 aa  629  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  77 
 
 
396 aa  625  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  76.81 
 
 
396 aa  626  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  77 
 
 
396 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  77 
 
 
396 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  77.75 
 
 
400 aa  622  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  79.5 
 
 
395 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  80 
 
 
396 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  80 
 
 
396 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  74.94 
 
 
399 aa  623  1e-177  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  76.5 
 
 
396 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  78.75 
 
 
395 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  73.33 
 
 
405 aa  620  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  80.75 
 
 
396 aa  620  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  80.75 
 
 
396 aa  620  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  75.56 
 
 
396 aa  620  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  75.56 
 
 
396 aa  620  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  73.33 
 
 
405 aa  620  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  76.81 
 
 
396 aa  619  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  77.06 
 
 
396 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  79.5 
 
 
395 aa  620  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  76.5 
 
 
396 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  73.87 
 
 
399 aa  618  1e-176  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  74.44 
 
 
399 aa  620  1e-176  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  76.13 
 
 
396 aa  619  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  75.62 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  75.62 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  76.43 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  75.62 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0129  elongation factor Tu  79 
 
 
395 aa  614  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000035963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0102  elongation factor Tu  79 
 
 
395 aa  614  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000109965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  75.62 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  75.62 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  75.62 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  75.62 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  75.62 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  75.62 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  75.62 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  75.62 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  80 
 
 
396 aa  615  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  76.06 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0120  elongation factor Tu  79 
 
 
395 aa  614  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.73817e-61 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  76.85 
 
 
405 aa  615  1e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  76.43 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  76.43 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  76.43 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  80 
 
 
396 aa  615  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0108  elongation factor Tu  79 
 
 
395 aa  614  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000587402  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  75.62 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  75.62 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  75.13 
 
 
394 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  75.13 
 
 
394 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  76.43 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  76.43 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  76.43 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  76.43 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  76.43 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  76.43 
 
 
396 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  75.13 
 
 
394 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  75.13 
 
 
394 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  75.62 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  76.43 
 
 
396 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  76.43 
 
 
396 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>