72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0186 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0186  PilT domain-containing protein  100 
 
 
380 aa  748    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0260  PilT protein domain protein  64.44 
 
 
383 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000167901  normal  0.0149964 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0185  PilT domain-containing protein  55.91 
 
 
371 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000117639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  55.94 
 
 
383 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0393  PilT protein domain protein  52.03 
 
 
388 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0400  PilT protein domain protein  57.59 
 
 
369 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0085  PilT protein domain protein  57.63 
 
 
364 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0127482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0081  PilT protein domain protein  56.39 
 
 
364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0838  PilT domain-containing protein  57 
 
 
367 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000323541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5221  hypothetical protein  49.21 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00102382  unclonable  1.43587e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0084  hypothetical protein  49.08 
 
 
369 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0084  hypothetical protein  49.08 
 
 
369 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0081  hypothetical protein  49.08 
 
 
369 aa  333  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0083  hypothetical protein  49.08 
 
 
369 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0080  hypothetical protein  49.08 
 
 
369 aa  333  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0079  PilT domain-containing protein  49.08 
 
 
370 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0105  hypothetical protein  48.82 
 
 
369 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0079  PilT domain-containing protein  54.77 
 
 
367 aa  328  8e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0165  PilT protein domain protein  51.2 
 
 
366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00910  PilT protein domain protein  58.87 
 
 
364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000274223  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  53.19 
 
 
363 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2427  PIN/TRAM domain-containing protein  52.69 
 
 
368 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2740  PIN/TRAM domain-containing protein  52.4 
 
 
368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0115  PilT protein domain protein  62.7 
 
 
257 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.673954  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0174  PilT protein domain protein  47.27 
 
 
367 aa  266  5e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  43.06 
 
 
346 aa  266  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0341  PilT protein domain protein  53.43 
 
 
346 aa  260  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220922  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  48.51 
 
 
384 aa  252  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1561  PilT protein domain protein  41.98 
 
 
357 aa  250  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2362  pili retraction protein PilT  52.16 
 
 
366 aa  250  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.36366  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0302  PilT domain-containing protein  40.94 
 
 
380 aa  248  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2600  PilT protein domain protein  43.48 
 
 
360 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3506  PilT protein domain protein  43.48 
 
 
360 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  0.104798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  39.08 
 
 
359 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  40.05 
 
 
383 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4268  PilT protein domain-containing protein  43.75 
 
 
358 aa  234  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0095  PilT protein domain protein  70.24 
 
 
168 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33572e-62 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4460  PilT protein domain protein  44.64 
 
 
360 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1195  PilT protein-like  39.18 
 
 
359 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2222  PilT protein-like  42.66 
 
 
358 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  56.41 
 
 
269 aa  226  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1002  PilT protein domain protein  38.38 
 
 
377 aa  223  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000369877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  40.07 
 
 
358 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  40.42 
 
 
357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  40.42 
 
 
357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3254  PilT protein domain protein  39.66 
 
 
366 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1733  PilT domain-containing protein  42.35 
 
 
361 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.147599 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2358  integral membrane protein  40.48 
 
 
361 aa  206  7e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2018  PilT domain-containing protein  41.43 
 
 
364 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0185  PilT domain-containing protein  36.67 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000320699  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  38.75 
 
 
385 aa  195  9e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1515  PilT protein domain protein  47.45 
 
 
331 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2116  PilT domain-containing protein  36.56 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0878  PIN domain superfamily protein  33.95 
 
 
369 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412243  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17331  integral membrane protein  33.68 
 
 
369 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.07903  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1298  PilT protein domain protein  38.85 
 
 
346 aa  179  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2177  PilT protein domain protein  47.15 
 
 
344 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0842  nucleotide binding protein, PINc  34.47 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.214431  normal  0.01039 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13601  integral membrane protein  34.9 
 
 
371 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.729181  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0998  PilT protein-like protein  47.42 
 
 
361 aa  167  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00567105  normal  0.0135719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1657  PilT domain-containing protein  41.46 
 
 
355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145178  normal  0.591632 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  42.64 
 
 
369 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20011  integral membrane protein  32.27 
 
 
389 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192672 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  42.64 
 
 
369 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  42.13 
 
 
369 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1547  nucleotide binding protein, PINc  41.84 
 
 
388 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111102  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14731  integral membrane protein  42.13 
 
 
369 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.961128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0094  hypothetical protein  36.52 
 
 
161 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  32.84 
 
 
602 aa  47  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  30.17 
 
 
634 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  28.86 
 
 
655 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  28.99 
 
 
633 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>