More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0133 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 393 aa  786    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  78.12 
 
 		 393 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  62.94 
 
 		 394 aa  521  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  64.47 
 
 		 394 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  63.96 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  62.69 
 
 		 394 aa  508  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  62.69 
 
 		 394 aa  508  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  65.39 
 
 		 393 aa  509  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  62.44 
 
 		 394 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  62.44 
 
 		 394 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  62.76 
 
 		 393 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  62.69 
 
 		 394 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  63.17 
 
 		 395 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  61.64 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  61.93 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  61.93 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  62.18 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  61.93 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  62.18 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  62.18 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  60.91 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  60.15 
 
 		 646 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  61.56 
 
 		 650 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  60.31 
 
 		 392 aa  487  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  60.76 
 
 		 396 aa  481  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  61 
 
 		 402 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  60.66 
 
 		 395 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  62.44 
 
 		 394 aa  478  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  60.35 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  60.35 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  60.91 
 
 		 395 aa  477  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  60.05 
 
 		 398 aa  472  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  59.75 
 
 		 395 aa  472  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  58.19 
 
 		 396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  58.94 
 
 		 399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  59.8 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  58.69 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  59.19 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  57.76 
 
 		 394 aa  465  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  60.55 
 
 		 401 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  56.68 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  58.94 
 
 		 400 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  58.6 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  58.94 
 
 		 400 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  56.78 
 
 		 402 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  58.5 
 
 		 401 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  58.75 
 
 		 401 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  61.06 
 
 		 400 aa  459  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  57.61 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  58.02 
 
 		 392 aa  458  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  58.54 
 
 		 401 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  59.75 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 		 402 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  56.78 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  56.89 
 
 		 402 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  57.11 
 
 		 402 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  58.29 
 
 		 401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  58.14 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  57.61 
 
 		 402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  56.17 
 
 		 400 aa  450  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  57.58 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  56.53 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  55.92 
 
 		 655 aa  448  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  58.48 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  59.05 
 
 		 400 aa  442  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  53.45 
 
 		 393 aa  438  9.999999999999999e-123  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  56.68 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  54.9 
 
 		 654 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  54.84 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  53.79 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  55.73 
 
 		 395 aa  434  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  54.57 
 
 		 396 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  53.96 
 
 		 403 aa  428  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  55.08 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  54.82 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  53.79 
 
 		 399 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  54.82 
 
 		 396 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  57.21 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  53.54 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  55.24 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  55.16 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1617  phosphoglycerate kinase  56.02 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0893272  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  52.03 
 
 		 395 aa  423  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  52.78 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  51.66 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  53.69 
 
 		 396 aa  423  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  56.3 
 
 		 394 aa  421  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  54.71 
 
 		 395 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  53.79 
 
 		 398 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  55.28 
 
 		 403 aa  418  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  53.05 
 
 		 393 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  53.3 
 
 		 389 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2515  phosphoglycerate kinase  56.17 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1430  Phosphoglycerate kinase  51.52 
 
 		 398 aa  413  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  55.19 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  53.18 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  53.63 
 
 		 399 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  50.64 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0677  phosphoglycerate kinase  55.27 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  52.81 
 
 		 395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>