More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0126 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  56.98 
 
 		 602 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.17 
 
 		 611 aa  780    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.12 
 
 		 608 aa  638    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  57.76 
 
 		 614 aa  703    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.71 
 
 		 637 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  55.21 
 
 		 700 aa  681    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  53.99 
 
 		 638 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.15 
 
 		 604 aa  635    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  59.11 
 
 		 633 aa  723    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.5 
 
 		 634 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  55.37 
 
 		 642 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.74 
 
 		 657 aa  827    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  54.42 
 
 		 634 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  58.94 
 
 		 633 aa  724    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  58.94 
 
 		 633 aa  724    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  58.94 
 
 		 633 aa  724    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  56.59 
 
 		 617 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.05 
 
 		 645 aa  644    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.93 
 
 		 633 aa  721    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  54.59 
 
 		 634 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.96 
 
 		 635 aa  643    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  52.32 
 
 		 643 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  57.29 
 
 		 682 aa  673    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.55 
 
 		 669 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.76 
 
 		 610 aa  677    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.5 
 
 		 620 aa  893    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.41 
 
 		 641 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.79 
 
 		 617 aa  671    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  56.17 
 
 		 613 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 615 aa  1245    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.54 
 
 		 697 aa  681    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.4 
 
 		 655 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  58.94 
 
 		 633 aa  724    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.83 
 
 		 635 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  57.34 
 
 		 616 aa  685    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 		 657 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.55 
 
 		 614 aa  655    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  55.08 
 
 		 617 aa  638    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 		 657 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  55.48 
 
 		 616 aa  640    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  57.02 
 
 		 608 aa  702    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  56.35 
 
 		 665 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  52.01 
 
 		 639 aa  641    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  58.94 
 
 		 633 aa  724    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  56.1 
 
 		 617 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  55.76 
 
 		 613 aa  679    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  55.28 
 
 		 619 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.55 
 
 		 753 aa  643    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.01 
 
 		 612 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  70.6 
 
 		 645 aa  832    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  53.96 
 
 		 635 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  65.82 
 
 		 753 aa  644    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.54 
 
 		 697 aa  681    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.67 
 
 		 630 aa  637    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  52.41 
 
 		 641 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.24 
 
 		 607 aa  655    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.8 
 
 		 640 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.21 
 
 		 634 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.42 
 
 		 610 aa  675    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  59.6 
 
 		 633 aa  721    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.17 
 
 		 616 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  58.94 
 
 		 633 aa  723    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.74 
 
 		 652 aa  650    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.3 
 
 		 687 aa  649    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.83 
 
 		 599 aa  667    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.71 
 
 		 640 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.91 
 
 		 635 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  54.82 
 
 		 637 aa  654    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  64.52 
 
 		 693 aa  780    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 		 657 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.89 
 
 		 651 aa  648    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  56.93 
 
 		 627 aa  696    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.79 
 
 		 656 aa  640    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.01 
 
 		 640 aa  642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.12 
 
 		 601 aa  676    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.12 
 
 		 601 aa  676    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  51.48 
 
 		 612 aa  638    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  56.22 
 
 		 613 aa  661    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.96 
 
 		 617 aa  675    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.05 
 
 		 657 aa  638    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.05 
 
 		 657 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.13 
 
 		 616 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.83 
 
 		 612 aa  692    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64 
 
 		 599 aa  789    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.04 
 
 		 638 aa  638    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.01 
 
 		 671 aa  655    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  59.4 
 
 		 689 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  55.93 
 
 		 617 aa  665    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.33 
 
 		 652 aa  671    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.95 
 
 		 639 aa  733    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.59 
 
 		 673 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.89 
 
 		 657 aa  636    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  57.14 
 
 		 654 aa  669    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.92 
 
 		 621 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55 
 
 		 634 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.33 
 
 		 634 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.4 
 
 		 676 aa  672    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  58.94 
 
 		 633 aa  724    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.39 
 
 		 647 aa  640    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.84 
 
 		 656 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>