29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0118 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0118  YabP family protein  100 
 
 
94 aa  187  6e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0222  sporulation protein YabP  55.32 
 
 
91 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  4.87754e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0077  YabP family protein  52.17 
 
 
102 aa  90.1  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2067  YabP family protein  42.55 
 
 
105 aa  82.8  2e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00460  YabP family protein  39.33 
 
 
97 aa  74.7  4e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0690  YabP family protein  38.89 
 
 
98 aa  70.1  9e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.733874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0088  hypothetical protein  42.7 
 
 
88 aa  68.2  3e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  8.56369e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2659  YabP-like protein  37.5 
 
 
96 aa  67  8e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.00526e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0072  sporulation protein YabP  43.18 
 
 
94 aa  66.2  1e-10  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.30985e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0085  hypothetical protein  38.2 
 
 
89 aa  65.5  2e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3083  sporulation protein YabP  41.46 
 
 
94 aa  65.9  2e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  4.16493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0138  sporulation protein YabP  44 
 
 
89 aa  63.2  1e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2800  sporulation protein YabP  32.56 
 
 
99 aa  57  8e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  7.15998e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0055  sporulation protein YabP  32.22 
 
 
101 aa  57  8e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00412609  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2486  sporulation protein YabP  32.56 
 
 
95 aa  57  8e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  3.42083e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0053  sporulation protein YabP  32.22 
 
 
101 aa  57  9e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0135  sporulation protein YabP  34.04 
 
 
94 aa  55.1  3e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000150113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0063  sporulation protein YabP  29.21 
 
 
102 aa  52.4  2e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0728049  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0650  YabP family protein  41.1 
 
 
91 aa  51.6  3e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  8.71774e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0053  YabP family protein  30.34 
 
 
102 aa  52  3e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0064  sporulation protein YabP  28.09 
 
 
102 aa  50.8  7e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0067  sporulation protein YabP  28.09 
 
 
102 aa  50.8  7e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00209322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0057  yabP protein  28.09 
 
 
102 aa  50.8  7e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.58102e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0053  YabP family protein  28.09 
 
 
102 aa  50.8  7e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.218275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0056  yabP protein  28.09 
 
 
102 aa  50.8  7e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.070874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0053  hypothetical protein  28.09 
 
 
108 aa  50.4  8e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.175441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0053  hypothetical protein  28.09 
 
 
108 aa  50.4  8e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.30321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0057  yabP protein  28.09 
 
 
108 aa  50.4  8e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.493381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5253  sporulation protein YabP  28.09 
 
 
102 aa  50.4  9e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000389897  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>