22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0096 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0096  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0203  hypothetical protein  45.1 
 
 
257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0301565  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0074  hypothetical protein  41.53 
 
 
250 aa  208  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2095  hypothetical protein  42.34 
 
 
252 aa  198  9e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0066  hypothetical protein  38.4 
 
 
258 aa  193  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21350  hypothetical protein  38.89 
 
 
251 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0601  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  37.5 
 
 
242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1536  hypothetical protein  35.08 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000297529  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0060  hypothetical protein  38.68 
 
 
253 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0057  hypothetical protein  35.36 
 
 
261 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2217  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0196  hypothetical protein  33.48 
 
 
231 aa  125  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2213  hypothetical protein  30.65 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1676  hypothetical protein  27.87 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440484  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2241  hypothetical protein  25.95 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3069  hypothetical protein  30.2 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659894  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0401  hypothetical protein  26.44 
 
 
282 aa  86.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0428202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1306  hypothetical protein  30.46 
 
 
188 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.47922  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44300  hypothetical protein  26.25 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2772  hypothetical protein  24.15 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3414  hypothetical protein  25 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.837558  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2497  nucleotidyl transferase  20.78 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>