26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0080 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0080  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  685    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.723937  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0200  hypothetical protein  48.96 
 
 
333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21680  hypothetical protein  47.77 
 
 
335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.2828  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2104  hypothetical protein  47.29 
 
 
334 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0423  hypothetical protein  47.49 
 
 
337 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1318  hypothetical protein  41.62 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.444184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2433  hypothetical protein  40.12 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0191  hypothetical protein  49.44 
 
 
182 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2406  hypothetical protein  35.96 
 
 
348 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1844  hypothetical protein  37.83 
 
 
346 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0114  hypothetical protein  51.66 
 
 
164 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0101503  hitchhiker  0.00333564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3934  hypothetical protein  36.67 
 
 
350 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4513  hypothetical protein  36.08 
 
 
324 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0177  hypothetical protein  35.06 
 
 
345 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1569  hypothetical protein  32.42 
 
 
353 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6760  hypothetical protein  31.01 
 
 
331 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3215  hypothetical protein  33.82 
 
 
379 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000550519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5160  hypothetical protein  28.7 
 
 
523 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417539  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2650  hypothetical protein  30.65 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0257  hypothetical protein  30.3 
 
 
332 aa  89.7  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  hitchhiker  0.00111717 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0312  hypothetical protein  37.32 
 
 
594 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0329  hypothetical protein  39.16 
 
 
594 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2993  hypothetical protein  24.19 
 
 
511 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.300626  normal  0.564635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3440  hypothetical protein  23.8 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00117447  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4685  hypothetical protein  23.08 
 
 
389 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192913  normal  0.0818693 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0311  hypothetical protein  28.81 
 
 
647 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>