More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0077 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
293 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  57.24 
 
 
305 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  55.71 
 
 
288 aa  309  4e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  52.43 
 
 
293 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  52.78 
 
 
291 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  51.21 
 
 
292 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  51.21 
 
 
292 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  51.21 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  51.21 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  51.21 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  51.21 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  51.21 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  51.21 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  51.21 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  51.21 
 
 
292 aa  279  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  51.21 
 
 
292 aa  279  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  47.46 
 
 
296 aa  277  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  49.11 
 
 
285 aa  275  5e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  49.11 
 
 
285 aa  275  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  51.06 
 
 
290 aa  275  6e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  48.62 
 
 
299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  48.44 
 
 
290 aa  271  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  49.3 
 
 
284 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  48.25 
 
 
297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  48.25 
 
 
297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  50.35 
 
 
290 aa  266  4e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  51.58 
 
 
297 aa  264  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  50.54 
 
 
294 aa  260  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  46.15 
 
 
301 aa  254  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  44.79 
 
 
280 aa  250  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  45.26 
 
 
295 aa  249  3e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  46.4 
 
 
290 aa  249  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  45.96 
 
 
292 aa  248  8e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  43.49 
 
 
297 aa  247  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  40.14 
 
 
302 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  45.49 
 
 
284 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  40.28 
 
 
291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  44.7 
 
 
273 aa  215  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  40.21 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  45.52 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  40.5 
 
 
291 aa  212  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  47.35 
 
 
278 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  42.81 
 
 
279 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  39.66 
 
 
290 aa  205  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  41.24 
 
 
275 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  40.07 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  39.51 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  43.45 
 
 
264 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 
302 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  39.65 
 
 
279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  40.88 
 
 
298 aa  195  8.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  39.33 
 
 
275 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  41.48 
 
 
266 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  39.56 
 
 
288 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  40.96 
 
 
288 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
267 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
267 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  41.18 
 
 
316 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  40.37 
 
 
266 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  38.63 
 
 
291 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  39.47 
 
 
275 aa  188  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  39.47 
 
 
275 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  40.74 
 
 
276 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  40.59 
 
 
268 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  40.58 
 
 
274 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 
268 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  41.9 
 
 
281 aa  185  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  39.31 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
276 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  36.68 
 
 
276 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  39.63 
 
 
272 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  39.59 
 
 
288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  38.98 
 
 
298 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  39.93 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  38.77 
 
 
268 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  38.2 
 
 
282 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  38.89 
 
 
268 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  38.97 
 
 
263 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  37.18 
 
 
271 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  38.83 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 
267 aa  177  1e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  41.16 
 
 
272 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  35.76 
 
 
289 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  39.73 
 
 
293 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  39.58 
 
 
260 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 
261 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 
263 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  39.58 
 
 
281 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  40.43 
 
 
268 aa  175  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  37.63 
 
 
264 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  39.51 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  39.03 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  37.98 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  41.61 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  39.86 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  40.21 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  35.48 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>