More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0071 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 267 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  58.87 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  62.69 
 
 		 260 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  58.02 
 
 		 262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  57.14 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  56.37 
 
 		 264 aa  299  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  54.41 
 
 		 270 aa  289  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  59.54 
 
 		 264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  56.32 
 
 		 263 aa  281  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  54.86 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  52.12 
 
 		 263 aa  254  7e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  55.47 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 		 265 aa  250  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 		 270 aa  244  8e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  52.87 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  52.09 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 		 270 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  53.31 
 
 		 285 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  51.76 
 
 		 270 aa  242  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  52.11 
 
 		 273 aa  241  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 270 aa  241  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 270 aa  241  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  52.16 
 
 		 270 aa  241  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 270 aa  241  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 270 aa  241  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 436 aa  238  5.999999999999999e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 268 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 268 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  45.9 
 
 		 290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  55.17 
 
 		 266 aa  234  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  52.65 
 
 		 271 aa  234  9e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  47.17 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  47.17 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 269 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 		 266 aa  232  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 		 323 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  45.11 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 		 266 aa  230  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 		 268 aa  228  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  48.68 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 		 268 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  46.25 
 
 		 266 aa  228  8e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 		 268 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 		 490 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  46.1 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  43.51 
 
 		 266 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  44.94 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  43.77 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 		 268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  44.7 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 266 aa  225  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  43.94 
 
 		 267 aa  224  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 		 269 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 288 aa  224  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  48.33 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 		 266 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 		 266 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  46.33 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  46.33 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 		 266 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 		 266 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  46.33 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 		 266 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  46.33 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  48.69 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 		 266 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  45.26 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  42.75 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>