More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0043 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  207  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  78.85 
 
 		 104 aa  167  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  72 
 
 		 102 aa  151  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  66.34 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  66.34 
 
 		 102 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  68.04 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  63.81 
 
 		 113 aa  137  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  62.63 
 
 		 99 aa  134  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  61.17 
 
 		 111 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  63.37 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  60.78 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  61 
 
 		 103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  60.78 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  59.62 
 
 		 104 aa  127  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  61.05 
 
 		 110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  57.69 
 
 		 104 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  64.71 
 
 		 104 aa  121  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  55.77 
 
 		 104 aa  121  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  58 
 
 		 103 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  52 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  54.81 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  57.14 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  54.29 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  53.85 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  55.34 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  54 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  63.92 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  53.92 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  53.92 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  63.54 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  57.89 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  60.82 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  50.48 
 
 		 112 aa  110  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  50.5 
 
 		 103 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  52.48 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  48 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  48.08 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  46.53 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  57.32 
 
 		 108 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  56.63 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  56.63 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  55.42 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  55.42 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  55.42 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  55.42 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  55.42 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  55.42 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  48 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  55.42 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  50.51 
 
 		 99 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  56.63 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  50.98 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  54.65 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  48 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  58.14 
 
 		 113 aa  98.6  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  49.02 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  47.37 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  45 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  46 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  55.95 
 
 		 100 aa  90.9  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1227  hypothetical protein  45.92 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0431183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  42 
 
 		 111 aa  90.1  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  41 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  43 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  45.05 
 
 		 101 aa  87.4  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  49.38 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  42.06 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  42.06 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  42.06 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  42.06 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  48.15 
 
 		 105 aa  84.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  48.15 
 
 		 105 aa  84.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  48 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  41.9 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  41.9 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  38.83 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  41.05 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  38.83 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  41.18 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  41.41 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  41.9 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  44.12 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  46.32 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  44.68 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  42.57 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  41.18 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  41.41 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2768  hypothetical protein  44.34 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  40.95 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1458  hypothetical protein  42.57 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.542371  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  41.18 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  40.4 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  44.55 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>