61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0032 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0032  heterodisulfide reductase, subunit A, selenocysteine-containing  100 
 
 		 72 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0356  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  60.29 
 
 		 660 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.84 
 
 		 1005 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.404382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.56 
 
 		 1010 aa  69.3  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0143  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.56 
 
 		 1010 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1353  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.06 
 
 		 660 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.576628 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0565  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.93 
 
 		 661 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2662  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  39.71 
 
 		 658 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.03 
 
 		 652 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0397  heterodisulfide reductase, subunit A, selenocysteine-containing  43.48 
 
 		 461 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0811  heterodisulfide reductase subunit  38.24 
 
 		 659 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746765 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17770  polyferredoxin, heterodixulfide reductase subunit A  41.18 
 
 		 660 aa  57  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2348  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.75 
 
 		 669 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.94 
 
 		 1126 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3583  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 665 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0149  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 665 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1306  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.91 
 
 		 656 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3426  heterodisulfide reductase subunit  35.82 
 
 		 665 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1109  heterodisulfide reductase, subunit A  39.39 
 
 		 656 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0582156  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1200  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.88 
 
 		 656 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.708049  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1260  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 656 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1885  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 		 1016 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 1006 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3013  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 1006 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.672431  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1029  heterodisulfide reductase, subunit A  36.36 
 
 		 656 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0503554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0090  heterodisulfide reductase subunit  31.34 
 
 		 665 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.078699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2149  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 1013 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.71 
 
 		 660 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.71 
 
 		 660 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1804  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 1009 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.769121 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 1013 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1209  heterodisulfide reductase, A subunit  35.48 
 
 		 660 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0864  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.82 
 
 		 665 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0821  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.1 
 
 		 1139 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3526  heterodisulfide reductase, A subunit  38.71 
 
 		 652 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0418  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 1142 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.718645  normal  0.455985 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0828  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 652 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0850  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.71 
 
 		 660 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0029  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.3 
 
 		 665 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0030  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.3 
 
 		 665 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0421  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.29 
 
 		 674 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.46069 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.32 
 
 		 632 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292871  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1838  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.26 
 
 		 671 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0974  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 658 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.540369  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0324  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 		 652 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.574765 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1709  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 658 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0972  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 658 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 658 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1212  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 655 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 950 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4164  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  37.1 
 
 		 632 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1977  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 1021 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3677  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 665 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667385  normal  0.188485 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 1481 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.71 
 
 		 653 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4316  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.1 
 
 		 632 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.689523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  32.79 
 
 		 792 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1453  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.68 
 
 		 1067 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.75 
 
 		 1105 aa  40.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0654  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  30.51 
 
 		 654 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.558651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  31.75 
 
 		 791 aa  40.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>