29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0030 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  686    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  34.66 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  29.22 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  31.06 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  26.62 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  30.46 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  28.61 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 333 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  26.38 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  25.53 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  28.35 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  28.8 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  26.02 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  25.09 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1316  hypothetical protein  29.29 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000132332  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4657  XRE family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0419  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 189 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000615648 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2307  hypothetical protein  26.47 
 
 		 204 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133913 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1337  transcriptional regulator, XRE family  30.09 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1375  XRE family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 136 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  32.98 
 
 		 131 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  26.96 
 
 		 168 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3487  hypothetical protein  33.04 
 
 		 274 aa  46.2  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000017923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3399  hypothetical protein  24.18 
 
 		 191 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0015092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1536  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 133 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0363  XRE family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 133 aa  42.7  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4193  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 133 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0845  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 131 aa  42.7  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>