221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0024 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0024  AAA ATPase  100 
 
 
266 aa  550  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3192  AAA ATPase  64.15 
 
 
266 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0103518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2001  AAA ATPase  64.15 
 
 
266 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.249052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1683  AAA ATPase  63.77 
 
 
266 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1711  AAA ATPase  63.77 
 
 
266 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2821  AAA ATPase  64.15 
 
 
266 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0311  AAA ATPase  63.4 
 
 
266 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0329  AAA ATPase  62.64 
 
 
266 aa  363  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1681  AAA ATPase  63.02 
 
 
266 aa  362  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0533  AAA ATPase  48.12 
 
 
266 aa  268  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2258  AAA ATPase  48.12 
 
 
266 aa  268  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1286  AAA ATPase  48.12 
 
 
266 aa  268  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1009  AAA ATPase  48.12 
 
 
266 aa  268  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3236  AAA ATPase  48.12 
 
 
266 aa  268  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1875  AAA ATPase  46.62 
 
 
266 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.871076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0382  AAA ATPase  46.62 
 
 
266 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0545  AAA ATPase  46.62 
 
 
266 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1329  AAA ATPase  46.62 
 
 
266 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1106  AAA ATPase  46.62 
 
 
266 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.597508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1829  AAA ATPase  43.61 
 
 
266 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.569708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12827  hypothetical protein  32.21 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.12444e-28  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5571  AAA ATPase  30.8 
 
 
271 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800357  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0555  AAA ATPase  30.42 
 
 
271 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0572  AAA ATPase  30.42 
 
 
271 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1689  AAA ATPase  30.42 
 
 
271 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2502  AAA ATPase  30.42 
 
 
271 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2927  AAA ATPase  30.42 
 
 
271 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600702  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5447  AAA ATPase  30.8 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739293  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4945  general secretion pathway protein-related protein  31.8 
 
 
271 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2048  general secretion pathway protein-related protein  32.18 
 
 
271 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00486349  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1286  general secretion pathway protein-related protein  32.18 
 
 
271 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.385442  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4519  general secretion pathway protein-related protein  32.18 
 
 
271 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1106  AAA ATPase  27.44 
 
 
275 aa  132  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000143994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3743  general secretion pathway protein-related protein  32.51 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.122195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  33.46 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  31.6 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  30.97 
 
 
266 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  32.18 
 
 
267 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.7 
 
 
558 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
587 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.82 
 
 
562 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.82 
 
 
562 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.82 
 
 
562 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  33.45 
 
 
554 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  31.73 
 
 
271 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  31.2 
 
 
298 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.21 
 
 
559 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.97 
 
 
557 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  31.58 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.45 
 
 
557 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.45 
 
 
557 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  31.58 
 
 
306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.45 
 
 
557 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.45 
 
 
557 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  31.2 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  31.84 
 
 
266 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  31.84 
 
 
266 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.61 
 
 
541 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  29.35 
 
 
505 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.25 
 
 
538 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.97 
 
 
613 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  27.14 
 
 
388 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.11 
 
 
572 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  30.08 
 
 
320 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  28.35 
 
 
388 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.67 
 
 
532 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  27.24 
 
 
422 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  29.96 
 
 
563 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  28.63 
 
 
274 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  29.84 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  28.24 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.93 
 
 
564 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  29.24 
 
 
584 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  29.74 
 
 
291 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  28.31 
 
 
498 aa  96.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  32.13 
 
 
304 aa  95.9  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  28.36 
 
 
519 aa  95.5  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  27.34 
 
 
427 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.51 
 
 
364 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  28.11 
 
 
371 aa  94  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  28.57 
 
 
385 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  28.04 
 
 
390 aa  92.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  29.37 
 
 
291 aa  92  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  29.81 
 
 
358 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  26.12 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  28.26 
 
 
318 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  28.36 
 
 
392 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  30.27 
 
 
439 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  29.35 
 
 
549 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1030  general secretion pathway protein A  27.61 
 
 
320 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00881191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  28.9 
 
 
334 aa  89.7  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  27.61 
 
 
302 aa  89.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  27.51 
 
 
302 aa  89  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.57 
 
 
395 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  28.15 
 
 
368 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  27.21 
 
 
563 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2098  type II secretory pathway ATPase ExeA  32.26 
 
 
257 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  27.74 
 
 
393 aa  86.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  26.67 
 
 
529 aa  86.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.8 
 
 
562 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>