More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3270 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  57.95 
 
 
576 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  100 
 
 
565 aa  1152    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  62.96 
 
 
568 aa  310  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  57.45 
 
 
767 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.49 
 
 
646 aa  292  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 
970 aa  233  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.27 
 
 
1352 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.83 
 
 
909 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  44.19 
 
 
998 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  44.79 
 
 
575 aa  216  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.14 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  44.86 
 
 
1046 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  45.19 
 
 
1346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 
442 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
977 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 
763 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  44.88 
 
 
729 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  46.06 
 
 
508 aa  212  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2771  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.74 
 
 
860 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.87 
 
 
853 aa  210  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 
456 aa  209  8e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.8 
 
 
687 aa  209  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 
1877 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.58 
 
 
858 aa  206  7e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 
1323 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
523 aa  206  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  42.07 
 
 
1053 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.74 
 
 
765 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2536  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
829 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 
832 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
582 aa  204  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.87 
 
 
921 aa  204  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.81 
 
 
933 aa  203  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  33.27 
 
 
948 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 
605 aa  203  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.86 
 
 
918 aa  203  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.23 
 
 
918 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.23 
 
 
918 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.23 
 
 
918 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 
371 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.23 
 
 
918 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  46.5 
 
 
882 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.23 
 
 
918 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
574 aa  202  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.73 
 
 
929 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 
627 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.66 
 
 
659 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 
778 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.57 
 
 
917 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  42.86 
 
 
918 aa  200  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
918 aa  200  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.86 
 
 
918 aa  200  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.86 
 
 
918 aa  200  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.86 
 
 
918 aa  200  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  42.86 
 
 
918 aa  200  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.86 
 
 
918 aa  200  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.86 
 
 
918 aa  200  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.86 
 
 
918 aa  200  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  42.08 
 
 
1323 aa  200  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.32 
 
 
1127 aa  200  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.86 
 
 
1002 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  43.55 
 
 
1014 aa  199  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
919 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.81 
 
 
1023 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.23 
 
 
931 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  39.82 
 
 
845 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.91 
 
 
1158 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 
917 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  41.85 
 
 
629 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 
484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.37 
 
 
1274 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
569 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  42.24 
 
 
823 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.21 
 
 
917 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
569 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4974  sensor histidine kinase  38.97 
 
 
299 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.23 
 
 
928 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1279 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.55 
 
 
1145 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.21 
 
 
917 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  41.67 
 
 
736 aa  197  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
641 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 
667 aa  197  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.14 
 
 
941 aa  197  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 
1240 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.06 
 
 
896 aa  196  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.58 
 
 
940 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  40.69 
 
 
1351 aa  196  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 
713 aa  196  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  40.48 
 
 
503 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 
1550 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 
1433 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  41.79 
 
 
925 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
587 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 
974 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 
798 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.57 
 
 
922 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3153  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.96 
 
 
842 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.256561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>