More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3238 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 438 aa  892    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  53.21 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  52.49 
 
 		 434 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  50.12 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  49.76 
 
 		 434 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  49.76 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  47.97 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  52.27 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  49.76 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  48.33 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  48.35 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  48.7 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  47.33 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  46.7 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  47.17 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  43.68 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  43.2 
 
 		 443 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  43.2 
 
 		 454 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  44.52 
 
 		 442 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  43.06 
 
 		 464 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  42.93 
 
 		 458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  41.29 
 
 		 444 aa  353  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  41.43 
 
 		 444 aa  349  7e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  41.43 
 
 		 444 aa  349  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 464 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  41.53 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  41.53 
 
 		 444 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  41.53 
 
 		 444 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  41.53 
 
 		 444 aa  346  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  41.53 
 
 		 444 aa  346  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  41.53 
 
 		 444 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  41.53 
 
 		 444 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  42.86 
 
 		 419 aa  346  4e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  41.29 
 
 		 443 aa  345  6e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  42.45 
 
 		 441 aa  336  5e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  41.67 
 
 		 418 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  43.33 
 
 		 436 aa  333  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  42.89 
 
 		 420 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  42.86 
 
 		 422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  42.38 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  43.41 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 443 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 458 aa  322  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  40.85 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  41.79 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  42.52 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  40.47 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  41.06 
 
 		 418 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  41.53 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  41.56 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  41.13 
 
 		 414 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  38.72 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  40.87 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  42.95 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  42.95 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  40.36 
 
 		 419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  42.51 
 
 		 420 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  42.51 
 
 		 420 aa  310  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  43.06 
 
 		 439 aa  309  8e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  39.29 
 
 		 416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  40.48 
 
 		 418 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  40.48 
 
 		 418 aa  306  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  40.48 
 
 		 418 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  40.48 
 
 		 418 aa  306  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  40.48 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  40.48 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  40.48 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  40.48 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  41.79 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  40.48 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  40.48 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  40.83 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  41.55 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  40.52 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  39.39 
 
 		 422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2180  glutamyl-tRNA reductase  42.31 
 
 		 438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00403267  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  40.1 
 
 		 418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 418 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  41.3 
 
 		 418 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  41.38 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  39.11 
 
 		 451 aa  302  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  40 
 
 		 418 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1855  glutamyl-tRNA reductase  42.27 
 
 		 418 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163682  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  41.13 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  41.13 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  40.82 
 
 		 428 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  39.01 
 
 		 432 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 428 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  39.24 
 
 		 432 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  40.49 
 
 		 423 aa  299  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  40.38 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  39.01 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  39.01 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  39.01 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  41.3 
 
 		 424 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  38.77 
 
 		 432 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  38.94 
 
 		 434 aa  296  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>