More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3218 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  100 
 
 
454 aa  902    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  50.44 
 
 
465 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  50.22 
 
 
453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  47.99 
 
 
452 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  39.52 
 
 
458 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  41.18 
 
 
458 aa  343  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  40.09 
 
 
458 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  40.43 
 
 
458 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  39.39 
 
 
458 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  38.96 
 
 
458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  39.08 
 
 
457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  38.96 
 
 
458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  38.86 
 
 
457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  38.86 
 
 
457 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  38.94 
 
 
450 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  38.65 
 
 
457 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  37.55 
 
 
458 aa  313  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  37.55 
 
 
457 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  38.21 
 
 
457 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  38.65 
 
 
457 aa  309  8e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  37.77 
 
 
457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  38.53 
 
 
450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  38.21 
 
 
457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  38.21 
 
 
457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  38.65 
 
 
457 aa  306  6e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  39.65 
 
 
458 aa  305  9.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  38.41 
 
 
458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  38.07 
 
 
457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  37.23 
 
 
458 aa  303  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  36.68 
 
 
458 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  35.73 
 
 
458 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  38.56 
 
 
457 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  38.11 
 
 
458 aa  300  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  37.75 
 
 
458 aa  299  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  37.75 
 
 
458 aa  299  7e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  37.75 
 
 
458 aa  299  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  36.68 
 
 
457 aa  299  8e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  36.88 
 
 
458 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  36.88 
 
 
458 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  37.99 
 
 
457 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  36.2 
 
 
458 aa  296  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  37.75 
 
 
458 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  37.53 
 
 
458 aa  295  9e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  37.69 
 
 
444 aa  294  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  35.37 
 
 
458 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  38.5 
 
 
458 aa  294  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  37.64 
 
 
450 aa  293  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  37.09 
 
 
458 aa  292  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  37.97 
 
 
458 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  37.97 
 
 
458 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  37.97 
 
 
458 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  37.97 
 
 
458 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  37.97 
 
 
458 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  37.97 
 
 
458 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  37.97 
 
 
458 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  37.97 
 
 
458 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  37.97 
 
 
458 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  37.75 
 
 
458 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  37.75 
 
 
458 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  37.75 
 
 
458 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  37.75 
 
 
458 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  37.75 
 
 
458 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  37.09 
 
 
458 aa  288  9e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  38.27 
 
 
457 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  36.64 
 
 
458 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  37.55 
 
 
457 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  35.98 
 
 
458 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  35.68 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2079  TrkA-N domain protein  37.25 
 
 
458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  36.24 
 
 
459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  37.53 
 
 
458 aa  280  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  34.82 
 
 
443 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  35.34 
 
 
458 aa  276  5e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  37.91 
 
 
458 aa  276  7e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  35.47 
 
 
467 aa  276  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  36.82 
 
 
477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  35.96 
 
 
469 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  35.98 
 
 
458 aa  270  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  35.46 
 
 
448 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  34.14 
 
 
448 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  33.18 
 
 
449 aa  268  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  36.03 
 
 
445 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  36.15 
 
 
469 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  36.15 
 
 
469 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  36.15 
 
 
469 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  35.29 
 
 
469 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  35.73 
 
 
469 aa  264  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  34.36 
 
 
449 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  35.11 
 
 
469 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  35.11 
 
 
469 aa  263  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  35.32 
 
 
469 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  35.52 
 
 
469 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  35.52 
 
 
469 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  35.52 
 
 
469 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  35.52 
 
 
469 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3437  potassium transporter peripheral membrane component  35.86 
 
 
452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  35.31 
 
 
469 aa  259  9e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  36.6 
 
 
459 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  35.32 
 
 
469 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  34.47 
 
 
469 aa  256  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>