246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3209 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  926    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  52.08 
 
 		 525 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  53.52 
 
 		 503 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  46.09 
 
 		 459 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  51.11 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  51.11 
 
 		 486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  50.49 
 
 		 554 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  50.26 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  46.84 
 
 		 531 aa  385  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  44.39 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  44.44 
 
 		 462 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  44.87 
 
 		 448 aa  360  3e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  44.29 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  51.89 
 
 		 364 aa  343  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  40.28 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  37.66 
 
 		 473 aa  333  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  42.66 
 
 		 442 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  44.72 
 
 		 479 aa  330  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  46.77 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  45.56 
 
 		 443 aa  323  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  46.36 
 
 		 402 aa  322  9.999999999999999e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  45.15 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  44.66 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  47.42 
 
 		 434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  48.64 
 
 		 501 aa  319  6e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  46.62 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  41.73 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  47.83 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  40.94 
 
 		 523 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  48.9 
 
 		 403 aa  289  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  41.62 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  42.77 
 
 		 398 aa  279  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  35.38 
 
 		 545 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  38.97 
 
 		 504 aa  272  8.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  44.88 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  43.37 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  39.25 
 
 		 445 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  41.74 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  38.8 
 
 		 451 aa  256  9e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  40.84 
 
 		 467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  40.45 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  34.41 
 
 		 532 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  36.93 
 
 		 425 aa  237  3e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  34.56 
 
 		 531 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  41.2 
 
 		 361 aa  236  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  39.88 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  40.19 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  38.62 
 
 		 419 aa  233  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  40.12 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  39.44 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  36.89 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  29.13 
 
 		 630 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  29.29 
 
 		 548 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  31.49 
 
 		 530 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  30.35 
 
 		 475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  31 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  31 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  31 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  31 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  31 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  31 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  30.92 
 
 		 513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  30.57 
 
 		 475 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  30.57 
 
 		 475 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  31.38 
 
 		 510 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  31.89 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  31.89 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  29.7 
 
 		 500 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  31.89 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  31.89 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  30.45 
 
 		 640 aa  170  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  30.38 
 
 		 485 aa  170  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  30.61 
 
 		 480 aa  169  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  27.7 
 
 		 535 aa  169  9e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  31.89 
 
 		 510 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  31.63 
 
 		 476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  32.06 
 
 		 520 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  32.52 
 
 		 518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  33.55 
 
 		 501 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  33.55 
 
 		 501 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0270  RmuC domain-containing protein  33.55 
 
 		 501 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557179  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  32.74 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  26.27 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  29.65 
 
 		 432 aa  159  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  32.67 
 
 		 520 aa  159  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  31.3 
 
 		 491 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  30.6 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  27.87 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  26.4 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  30.67 
 
 		 495 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  25.67 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  29.65 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  29.97 
 
 		 506 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  30.53 
 
 		 495 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  30.67 
 
 		 495 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  33.78 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  28.11 
 
 		 448 aa  156  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  31.16 
 
 		 501 aa  156  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  30.28 
 
 		 495 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  31.76 
 
 		 492 aa  156  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>