More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3178 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  56.33 
 
 		 582 aa  681    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 578 aa  1189    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  49.13 
 
 		 577 aa  595  1e-168  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  42.99 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  40.6 
 
 		 344 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  40.6 
 
 		 344 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  42.99 
 
 		 344 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  38.81 
 
 		 347 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  38.51 
 
 		 347 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  42.99 
 
 		 344 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  38.21 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  38.54 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  38.1 
 
 		 341 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  44.2 
 
 		 346 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  38.32 
 
 		 342 aa  233  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  43.89 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  37.61 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  37.91 
 
 		 343 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  39.47 
 
 		 345 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  37.69 
 
 		 346 aa  223  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  42.09 
 
 		 343 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  37.39 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  38.1 
 
 		 361 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  39.55 
 
 		 342 aa  220  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  38.87 
 
 		 345 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  42.29 
 
 		 342 aa  213  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  37.98 
 
 		 345 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  35.21 
 
 		 341 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  40.32 
 
 		 342 aa  209  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  40.51 
 
 		 341 aa  208  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  38.32 
 
 		 341 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  38.1 
 
 		 368 aa  206  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  39.63 
 
 		 340 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  39.63 
 
 		 340 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  39.27 
 
 		 340 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  39.27 
 
 		 340 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  39.27 
 
 		 340 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  39.63 
 
 		 340 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  37.1 
 
 		 325 aa  202  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  39.02 
 
 		 340 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  38.44 
 
 		 354 aa  200  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  38.17 
 
 		 358 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  36.57 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  38.87 
 
 		 342 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  38.03 
 
 		 315 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  34.42 
 
 		 341 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  37.42 
 
 		 345 aa  196  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  40.99 
 
 		 356 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  36.42 
 
 		 341 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  39.86 
 
 		 357 aa  193  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  42.8 
 
 		 359 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 		 340 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  38.19 
 
 		 342 aa  190  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  37.43 
 
 		 341 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  38.44 
 
 		 353 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  37.98 
 
 		 341 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  37.98 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  37.72 
 
 		 346 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  37.69 
 
 		 341 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  37.8 
 
 		 340 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  37.69 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  37.69 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  40.45 
 
 		 340 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.45 
 
 		 340 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  39.74 
 
 		 340 aa  183  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  37.5 
 
 		 340 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  40.07 
 
 		 340 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.07 
 
 		 340 aa  180  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.07 
 
 		 340 aa  180  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.07 
 
 		 340 aa  180  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.07 
 
 		 340 aa  180  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  38.24 
 
 		 353 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  42.12 
 
 		 341 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  36.14 
 
 		 340 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  35.71 
 
 		 407 aa  152  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  34.26 
 
 		 346 aa  150  5e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  33.54 
 
 		 336 aa  143  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  39.01 
 
 		 312 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  35.29 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  38.6 
 
 		 312 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  30.63 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  36.1 
 
 		 309 aa  134  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  33.22 
 
 		 380 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  33.99 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  39.29 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  38.84 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.9 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  32.02 
 
 		 316 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  30.84 
 
 		 340 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  32.41 
 
 		 334 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  39.89 
 
 		 370 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  30.65 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  30.75 
 
 		 344 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  36.72 
 
 		 306 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  37.78 
 
 		 306 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  35.79 
 
 		 379 aa  128  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  29.86 
 
 		 309 aa  127  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  31.71 
 
 		 316 aa  127  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  35.98 
 
 		 365 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  35.82 
 
 		 336 aa  126  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>