More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3169 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 442 aa  853    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0224  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.47 
 
 		 436 aa  408  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274555  normal  0.678538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5288  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.46 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.2 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.88 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.77 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.54 
 
 		 433 aa  352  7e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.54 
 
 		 433 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.07 
 
 		 433 aa  351  1e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.02 
 
 		 429 aa  348  8e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  45.95 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.98 
 
 		 431 aa  346  4e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.12 
 
 		 431 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  46.26 
 
 		 430 aa  342  8e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.88 
 
 		 431 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  44.85 
 
 		 431 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  44 
 
 		 441 aa  341  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.19 
 
 		 430 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.88 
 
 		 431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5276  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.02 
 
 		 466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420426  normal  0.809704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.88 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  46.03 
 
 		 430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.82 
 
 		 453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  44.62 
 
 		 431 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  44.76 
 
 		 430 aa  339  5.9999999999999996e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.16 
 
 		 431 aa  338  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.42 
 
 		 431 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  44.91 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.59 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.63 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.22 
 
 		 430 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.88 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.36 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.16 
 
 		 431 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  44.42 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  45 
 
 		 431 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  44.42 
 
 		 429 aa  335  9e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.42 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0462  xanthine/uracil permease family protein  45.27 
 
 		 458 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.859148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3022  xanthine/uracil permease family protein  45.27 
 
 		 458 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0167  hypothetical protein  45.27 
 
 		 458 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2977  hypothetical protein  45.27 
 
 		 458 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2917  hypothetical protein  45.27 
 
 		 482 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2608  hypothetical protein  45.27 
 
 		 458 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503637  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0980  hypothetical protein  45.27 
 
 		 458 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2527  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.48 
 
 		 444 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3105  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.13 
 
 		 458 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  41.89 
 
 		 465 aa  331  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  41.67 
 
 		 465 aa  330  4e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.71 
 
 		 431 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  44.85 
 
 		 494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  42.86 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  45.5 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.09 
 
 		 454 aa  326  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.63 
 
 		 436 aa  326  6e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.36 
 
 		 429 aa  326  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.46 
 
 		 434 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.46 
 
 		 434 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.36 
 
 		 429 aa  325  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.16 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2711  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.05 
 
 		 448 aa  324  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172353  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  42.62 
 
 		 449 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.69 
 
 		 446 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.06 
 
 		 429 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.56 
 
 		 433 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.56 
 
 		 433 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.56 
 
 		 433 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.06 
 
 		 429 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  41.55 
 
 		 434 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.06 
 
 		 429 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.06 
 
 		 429 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  42.33 
 
 		 433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.96 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.03 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  43.97 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.98 
 
 		 461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.19 
 
 		 429 aa  319  5e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.37 
 
 		 437 aa  319  5e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.52 
 
 		 446 aa  319  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.55 
 
 		 429 aa  319  7e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.76 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.09 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.58 
 
 		 462 aa  317  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  41.86 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  41.63 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.86 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  41.86 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  41.86 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.33 
 
 		 449 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.96 
 
 		 430 aa  316  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.86 
 
 		 433 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.09 
 
 		 449 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.33 
 
 		 449 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  42.29 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.09 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.06 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  42.43 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.49 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.49 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.49 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>