285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3066 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  947    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  46.24 
 
 		 492 aa  404  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  41.79 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  42.83 
 
 		 452 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  42.83 
 
 		 452 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  42.83 
 
 		 452 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  43.35 
 
 		 449 aa  297  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04550  cyclase/dehydrase ; Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.1 
 
 		 532 aa  295  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  293  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3582  domain of unknown function DUF1731  40.26 
 
 		 448 aa  282  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  49.16 
 
 		 303 aa  264  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  38.08 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  43.77 
 
 		 300 aa  263  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  48.33 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  46.03 
 
 		 298 aa  246  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  45.7 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.85 
 
 		 296 aa  233  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  41.04 
 
 		 302 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  41.04 
 
 		 302 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  41.04 
 
 		 302 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  42.35 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  45.24 
 
 		 297 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3558  hypothetical protein  46.33 
 
 		 303 aa  229  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69545  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  42.3 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.32 
 
 		 297 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  43.81 
 
 		 300 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  43.46 
 
 		 305 aa  227  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3324  hypothetical protein  46.21 
 
 		 303 aa  222  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  43.82 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  40.99 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.28 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 		 301 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  40.4 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  41 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  40.67 
 
 		 297 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  40.79 
 
 		 297 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  40.79 
 
 		 297 aa  217  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  40.79 
 
 		 297 aa  217  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  40.79 
 
 		 297 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  44.04 
 
 		 304 aa  217  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  40.33 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  38.44 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  40.33 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  40.33 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  40.67 
 
 		 297 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  45 
 
 		 301 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3362  domain of unknown function DUF1731  40.13 
 
 		 302 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  41.72 
 
 		 302 aa  216  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40.46 
 
 		 297 aa  216  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40.26 
 
 		 297 aa  216  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  37.79 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  37.79 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  41 
 
 		 297 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  39.93 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  37.13 
 
 		 301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  38.11 
 
 		 301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  38.87 
 
 		 300 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  37.46 
 
 		 301 aa  212  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  37.46 
 
 		 301 aa  212  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  37.79 
 
 		 301 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  38.36 
 
 		 301 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0941  domain of unknown function DUF1731  44.52 
 
 		 308 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107088  normal  0.0358656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  40.6 
 
 		 292 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  40.07 
 
 		 313 aa  209  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  41.39 
 
 		 313 aa  209  9e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0996  hypothetical protein  41.2 
 
 		 302 aa  209  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  38.69 
 
 		 301 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  38.03 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  38.89 
 
 		 313 aa  209  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  38.13 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  37.46 
 
 		 301 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  39.53 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10480  conserved hypothetical protein TIGR01777  42.71 
 
 		 294 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0100151  normal  0.069874 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  38.06 
 
 		 306 aa  207  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.6 
 
 		 301 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  36.57 
 
 		 306 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  36.36 
 
 		 297 aa  206  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  35.83 
 
 		 301 aa  206  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  37.87 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  38.71 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  38.28 
 
 		 302 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  37.01 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  38.41 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  41.33 
 
 		 298 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  37.46 
 
 		 304 aa  203  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1851  hypothetical protein  38.13 
 
 		 289 aa  202  7e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.6 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1735  domain of unknown function DUF1731  41.89 
 
 		 307 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.284327  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.19 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6071  domain of unknown function DUF1731  40.26 
 
 		 303 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  37.46 
 
 		 298 aa  201  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  37.63 
 
 		 294 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  38.82 
 
 		 304 aa  201  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3075  domain of unknown function DUF1731  41.47 
 
 		 294 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  39.13 
 
 		 295 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  37.3 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15450  conserved hypothetical protein TIGR01777  41.08 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  36.54 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  40.73 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>