More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3053 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  100 
 
 		 360 aa  739    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  73.54 
 
 		 360 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  67.97 
 
 		 360 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  66.57 
 
 		 360 aa  498  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  61.32 
 
 		 369 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  60.57 
 
 		 372 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  56.5 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  56.86 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  55.62 
 
 		 357 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  56.21 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  55.08 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4274  twitching motility protein  56.34 
 
 		 356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  54.44 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  58.05 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  56.5 
 
 		 347 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  56.08 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  56.19 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  58.56 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  57.36 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  53.94 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  54.46 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  54.46 
 
 		 345 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  54.17 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  53.87 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  56.5 
 
 		 347 aa  378  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  53.87 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  57.96 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  58.26 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  53.87 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  57.19 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  54.17 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  54.17 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  57.19 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  54.17 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  54.38 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  54.36 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  54.46 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  53.57 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  55.2 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  57.66 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  57.06 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  53.87 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  53.01 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  57.06 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  53.49 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  55.39 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  52.86 
 
 		 364 aa  371  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  56.76 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  56.76 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  56.76 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  53.1 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  57.06 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  55.39 
 
 		 344 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  55.26 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  52.65 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  54.49 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  54.68 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  54.19 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  52.75 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  54.38 
 
 		 345 aa  364  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  55.18 
 
 		 344 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  54.38 
 
 		 344 aa  362  4e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  53.78 
 
 		 347 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  53.78 
 
 		 347 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  53.45 
 
 		 347 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  54.19 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  54.19 
 
 		 345 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  54.33 
 
 		 345 aa  359  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  53.78 
 
 		 345 aa  359  4e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  52.99 
 
 		 344 aa  359  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  54.35 
 
 		 344 aa  358  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  53.47 
 
 		 347 aa  358  7e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  55.15 
 
 		 346 aa  358  9e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  52.85 
 
 		 347 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  54.25 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  52.99 
 
 		 344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  52.46 
 
 		 566 aa  356  3.9999999999999996e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  51.34 
 
 		 347 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  53.2 
 
 		 378 aa  355  5e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  53.17 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  51.34 
 
 		 349 aa  354  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  49.31 
 
 		 365 aa  352  8e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  52.24 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  52.77 
 
 		 362 aa  351  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  51.33 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  50.6 
 
 		 349 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  50.6 
 
 		 349 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  49.7 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  49.7 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  51.5 
 
 		 344 aa  348  6e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  51.3 
 
 		 403 aa  344  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  53.25 
 
 		 339 aa  343  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  46.46 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  46.46 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  46.18 
 
 		 366 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  46.46 
 
 		 365 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  51.16 
 
 		 350 aa  339  5e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  49.14 
 
 		 372 aa  339  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  47.37 
 
 		 374 aa  338  5.9999999999999996e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  50.15 
 
 		 351 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>