91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3034 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  208  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  40.66 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  38.71 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  36.96 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  38.82 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  50 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  42.86 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  48.44 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3726  hypothetical protein  38.37 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.40241  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  37.97 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  33.7 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  33.7 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  33.7 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  31.87 
 
 
93 aa  57  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  35.37 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  35.37 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  45.76 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  58.7 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1716  protein of unknown function DUF503  50.82 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  29.35 
 
 
93 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  30.11 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1142  hypothetical protein  35 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1180  hypothetical protein  35 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  34.78 
 
 
95 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  26.88 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0956  hypothetical protein  24.21 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3135  hypothetical protein  37.5 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1915  hypothetical protein  35.11 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.650428  hitchhiker  0.0000323076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3147  hypothetical protein  37.5 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.647728  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3461  hypothetical protein  36.25 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3197  hypothetical protein  37.5 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397564  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2415  protein of unknown function DUF503  30.11 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  42.19 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  33.33 
 
 
98 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12149  hypothetical protein  48 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2785  protein of unknown function DUF503  30.53 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3330  protein of unknown function DUF503  40 
 
 
101 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.157533  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1183  hypothetical protein  54.35 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475704  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2131  protein of unknown function DUF503  40.58 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1177  hypothetical protein  32.1 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0779  hypothetical protein  41.07 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  39.44 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1334  hypothetical protein  27.96 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0659089  hitchhiker  0.00140554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0676  protein of unknown function DUF503  32.5 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5833  protein of unknown function DUF503  35.9 
 
 
98 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.758203  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1743  protein of unknown function DUF503  40 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3553  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3571  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3663  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.394752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3949  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3850  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3859  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000276858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3823  hypothetical protein  28.57 
 
 
83 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8421e-63 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1705  hypothetical protein  38.46 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000331281  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0361  protein of unknown function DUF503  28.42 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1062  hypothetical protein  54.35 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.0510032 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  43.4 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  32.99 
 
 
98 aa  47  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3910  hypothetical protein  27.27 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.359011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3634  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0542706  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3066  hypothetical protein  34.18 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0539  hypothetical protein  47.83 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3852  protein of unknown function DUF503  27.17 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.411613  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2730  protein of unknown function DUF503  40.35 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2411  hypothetical protein  43.86 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137349  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2464  hypothetical protein  29.87 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0145218  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  37.66 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  46.81 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0494  protein of unknown function DUF503  26.88 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.750456  normal  0.915938 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1998  hypothetical protein  25 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0235634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2117  hypothetical protein  44.64 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2208  protein of unknown function DUF503  41.82 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000107247  decreased coverage  0.00036449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1067  protein of unknown function DUF503  45.45 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540622  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  43.4 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1450  hypothetical protein  34.78 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0274551  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1157  hypothetical protein  45.45 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388094  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3266  protein of unknown function DUF503  40.82 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0150914  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4216  hypothetical protein  42.31 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.472071  normal  0.0308507 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0985  protein of unknown function DUF503  37.25 
 
 
93 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.531041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2048  protein of unknown function DUF503  40 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2434  hypothetical protein  25.81 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.211063  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7741  protein of unknown function DUF503  51.22 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.768404  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3163  hypothetical protein  25.77 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1963  hypothetical protein  27.06 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0058  protein of unknown function DUF503  23.53 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1156  protein of unknown function DUF503  38 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0708  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2512  protein of unknown function DUF503  24.47 
 
 
102 aa  40  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>