100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3014 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 175 aa  333  5e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  73.71 
 
 		 175 aa  266  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  72.09 
 
 		 174 aa  254  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  78.29 
 
 		 175 aa  250  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  70.29 
 
 		 175 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  60.23 
 
 		 176 aa  202  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  66.47 
 
 		 173 aa  174  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  43.93 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  49.38 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.1 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  47.62 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.48 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 		 647 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  44.06 
 
 		 192 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  35.8 
 
 		 419 aa  98.6  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  35.71 
 
 		 186 aa  98.2  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  44.44 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.12 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  34.01 
 
 		 205 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  36 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.84 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  34.42 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  37.01 
 
 		 399 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  34.19 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.58 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  29.58 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.34 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  39.34 
 
 		 218 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  38.52 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.3 
 
 		 352 aa  68.2  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  41.18 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.5 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.83 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.4 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  30.71 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  30.71 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.43 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  30.25 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.59 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  31.85 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  26.26 
 
 		 371 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.95 
 
 		 330 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.07 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  31.25 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.68 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.34 
 
 		 354 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0437  hypothetical protein  34.4 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.275295 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.67 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.08 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.1 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  31.4 
 
 		 149 aa  51.2  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.01 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.04 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.58 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.01 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.53 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.05 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.54 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 290 aa  49.3  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  29.41 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.25 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.16 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.87 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  65.62 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3646  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.17 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.415893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.28 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  33.07 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.83 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2677  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.03 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  47.83 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0398  hypothetical protein  31.2 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.11 
 
 		 371 aa  45.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2518  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  25.56 
 
 		 344 aa  44.3  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0443  hypothetical protein  30.43 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1402  YeeE/YedE family protein  30.43 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.218972  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0357  YeeE/YedE family protein  30.43 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1812  YeeE/YedE family protein  30.43 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1898  hypothetical protein  30.43 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154613  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0204  hypothetical protein  30.43 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0939  hypothetical protein  30.43 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0458  hypothetical protein  30.4 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  25.58 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1744  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.48 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157818 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3749  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.68 
 
 		 136 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6242  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.36 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0335  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.07 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1336  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.34 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0232  YeeE/YedE  28.57 
 
 		 143 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05710  hypothetical protein  51.22 
 
 		 146 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  32.1 
 
 		 385 aa  42  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.72 
 
 		 139 aa  42  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.522142  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1027  hypothetical protein  46.81 
 
 		 143 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645004  normal  0.157652 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5569  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.83 
 
 		 160 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0380348  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1572  hypothetical protein  26.72 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2437  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.82 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0856  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.61 
 
 		 149 aa  40.8  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000840369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6794  hypothetical protein  27.89 
 
 		 150 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>