More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3001 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  858    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 434 aa  335  9e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 445 aa  266  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 425 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 432 aa  212  7.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 434 aa  213  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 417 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  31.16 
 
 		 430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  31.16 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  30.79 
 
 		 432 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  30.79 
 
 		 432 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  34.01 
 
 		 437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  33.5 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  30.1 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  29.58 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  29.98 
 
 		 443 aa  156  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  30.35 
 
 		 430 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  30.35 
 
 		 430 aa  156  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  27.46 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  27.91 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  27.91 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  29.08 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 407 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  28.8 
 
 		 425 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  29.74 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  29.49 
 
 		 428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  26.76 
 
 		 428 aa  130  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  26.52 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  27.3 
 
 		 431 aa  124  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  26.42 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  26.97 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  27.25 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  26.82 
 
 		 431 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  27.21 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  27.58 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  27.34 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  28.64 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  27.62 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  28.4 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  22.2 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  25.17 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  25.17 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  26.3 
 
 		 483 aa  107  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  21.96 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  25.81 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  27.07 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  30.71 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  28.18 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  25.2 
 
 		 452 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  25.2 
 
 		 452 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.71 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 389 aa  99.8  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  26.52 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 424 aa  97.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 441 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  23.53 
 
 		 410 aa  97.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 434 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 432 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  25.54 
 
 		 366 aa  96.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  24.55 
 
 		 454 aa  96.7  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  25.54 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 439 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  23.26 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  26.12 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>