40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2962 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2962  vitamin B12 dependent methionine synthase activation region  100 
 
 		 250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.15104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0060  vitamin B12 dependent methionine synthase activation region  38.12 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3080  Vitamin B12 dependent methionine synthase activation region  28.8 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1791  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  25.56 
 
 		 173 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.595123  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23500  vitamin B12 dependent methionine synthase  26.64 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.730833  hitchhiker  0.000030345 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0679  vitamin B12 dependent methionine synthase activation region  27.17 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.59696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0655  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  25.54 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.766498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15340  Vitamin B12 dependent methionine synthase, activation domain protein  23.62 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3878  Vitamin B12 dependent methionine synthase activation region  26.67 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0730  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  33.62 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0644  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  28.32 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  26.87 
 
 		 821 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2208  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  27.59 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000120286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0769  hypothetical protein  27.1 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394744  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  34.83 
 
 		 1150 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  34.83 
 
 		 1150 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  34.83 
 
 		 1150 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4340  hypothetical protein  23.11 
 
 		 453 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1309  vitamin B12 dependent methionine synthase activation region  25.17 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  32 
 
 		 1136 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0594  methionine synthase  31.62 
 
 		 905 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0250  methionine synthase  31.62 
 
 		 905 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.344603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1344  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.62 
 
 		 905 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.471509  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0190  methionine synthase  28.68 
 
 		 905 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0413  methionine synthase  31.62 
 
 		 905 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0433  methionine synthase  31.62 
 
 		 905 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0790009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3219  methionine synthase  31.62 
 
 		 905 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  27.56 
 
 		 1169 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0357  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.62 
 
 		 905 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  32.85 
 
 		 1225 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1860  hypothetical protein  27.05 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.415812  normal  0.375551 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  32.12 
 
 		 1228 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0088  methionine synthase (B12-dependent)  31.82 
 
 		 915 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.3983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  26.8 
 
 		 1195 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  26.38 
 
 		 1264 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  26.38 
 
 		 1264 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  31.25 
 
 		 1237 aa  42.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  26.38 
 
 		 1220 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  26.67 
 
 		 1136 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  25 
 
 		 1132 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>