189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2932 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2932  nuclease  100 
 
 		 244 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  45.73 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  45 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  38.83 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  36.89 
 
 		 221 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  42.86 
 
 		 153 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  35.18 
 
 		 216 aa  130  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  43.11 
 
 		 227 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  43.79 
 
 		 148 aa  124  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  42.75 
 
 		 192 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  42.96 
 
 		 182 aa  122  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  40.38 
 
 		 174 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  48.87 
 
 		 153 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  38.85 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  35.52 
 
 		 184 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  44.7 
 
 		 153 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  45.19 
 
 		 150 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  40.69 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  37.11 
 
 		 156 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  37.65 
 
 		 175 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  36.48 
 
 		 171 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  37.58 
 
 		 153 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  34.64 
 
 		 161 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  34.08 
 
 		 187 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  40.58 
 
 		 162 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  34.3 
 
 		 180 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  42.86 
 
 		 153 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  34.09 
 
 		 169 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  38.92 
 
 		 171 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  37.59 
 
 		 187 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  40.94 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  33.54 
 
 		 175 aa  105  7e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  38.3 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  37.25 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  38.62 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  36.47 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2368  nuclease (SNase domain protein)  38.33 
 
 		 122 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  37.04 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  35.88 
 
 		 175 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  32 
 
 		 183 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  38.41 
 
 		 196 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  35.81 
 
 		 169 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  35.9 
 
 		 166 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  39.29 
 
 		 164 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  31.25 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  37.5 
 
 		 185 aa  95.5  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  35.33 
 
 		 155 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  38.26 
 
 		 205 aa  95.1  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  38.16 
 
 		 191 aa  95.1  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 		 183 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  31.01 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  32 
 
 		 205 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  37.14 
 
 		 175 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  34.5 
 
 		 233 aa  92  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  37.16 
 
 		 193 aa  92  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  33.54 
 
 		 171 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  43.18 
 
 		 162 aa  91.3  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  31.85 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  31.18 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  36.91 
 
 		 179 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  35 
 
 		 194 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30.32 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  33.33 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  35.33 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  33.33 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  28.39 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  31.61 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  29.68 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  30.25 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  30.2 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  26.8 
 
 		 166 aa  72  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  40.45 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  30.26 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0502  hypothetical protein  43.4 
 
 		 77 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  30.63 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  30.63 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  28.48 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  26.23 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  31.98 
 
 		 161 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  32.45 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  33.82 
 
 		 163 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  32.45 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  29.56 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  29.8 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  27.9 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  27.23 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.76 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  25.59 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1415  hypothetical protein  54.35 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  31.82 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  30.58 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  27.33 
 
 		 183 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  32.59 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  34.68 
 
 		 176 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  28.45 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  35.05 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  25.45 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  24.77 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  25.34 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  26.39 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>