261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2928 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  30.62 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  29.17 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  34.16 
 
 
249 aa  105  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  30.48 
 
 
234 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  30.73 
 
 
236 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  28.37 
 
 
227 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  28.12 
 
 
243 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  33.5 
 
 
244 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  29.28 
 
 
244 aa  99  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
241 aa  99  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  29.02 
 
 
261 aa  99  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  42.06 
 
 
262 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  28.91 
 
 
224 aa  98.2  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  29.09 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  30.23 
 
 
224 aa  95.9  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  28.64 
 
 
227 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  35.58 
 
 
268 aa  94.7  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  25.7 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  30.24 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  28.43 
 
 
251 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  27.78 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  27.78 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  25.51 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  29.38 
 
 
239 aa  92.4  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  30.19 
 
 
221 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  26.89 
 
 
237 aa  92  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  27.45 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  28.5 
 
 
238 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  29.59 
 
 
233 aa  90.1  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  27.73 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  28.22 
 
 
300 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  26.51 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  26.37 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  27.47 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  29.05 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  40.59 
 
 
249 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  28.22 
 
 
300 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  38.54 
 
 
292 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  39.58 
 
 
301 aa  89  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  25.25 
 
 
252 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  38.54 
 
 
292 aa  89  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  25.98 
 
 
240 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  37.5 
 
 
286 aa  88.2  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  41.58 
 
 
279 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  26.83 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  26.32 
 
 
237 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  27.08 
 
 
240 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  38.54 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  27.78 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  27.78 
 
 
254 aa  86.7  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  25.78 
 
 
243 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  30.62 
 
 
292 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  30.62 
 
 
292 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  30.62 
 
 
292 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  30.62 
 
 
292 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  30.62 
 
 
292 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  30.62 
 
 
292 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  30.62 
 
 
292 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  38.61 
 
 
278 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  38.1 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  33.64 
 
 
241 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  28.11 
 
 
240 aa  85.9  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  30.14 
 
 
295 aa  85.5  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  33.64 
 
 
260 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  38.83 
 
 
256 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  39.58 
 
 
285 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  26.6 
 
 
240 aa  85.1  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  33.64 
 
 
241 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  28.64 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  28.64 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  39.81 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  25.47 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  24.88 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  38.61 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  38.61 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  38.54 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  28.85 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  35.42 
 
 
292 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  28.7 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  38.54 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  26.44 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  38.54 
 
 
303 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  38.54 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  38.54 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  35.51 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  34.65 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  35.51 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  27.91 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  25.37 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  25 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  30 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  24.77 
 
 
234 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  25.52 
 
 
245 aa  81.6  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  37.62 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  25.13 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  36.19 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  26.24 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  29.81 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>