19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2893 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2893  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  564  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3174  hypothetical protein  64.34 
 
 
273 aa  340  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1376  hypothetical protein  54.24 
 
 
273 aa  269  3e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1649  hypothetical protein  52.42 
 
 
274 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140534  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1527  hypothetical protein  47.6 
 
 
250 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0116  protein of unknown function DUF169  50.75 
 
 
265 aa  233  2e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011799  hitchhiker  0.00705283 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0039  hypothetical protein  47.19 
 
 
267 aa  218  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2260  hypothetical protein  38.27 
 
 
279 aa  167  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.087732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2481  hypothetical protein  36.76 
 
 
274 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2252  protein of unknown function DUF169  33.33 
 
 
238 aa  158  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0407  hypothetical protein  33.69 
 
 
279 aa  152  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0332  hypothetical protein  36.96 
 
 
278 aa  152  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1049  hypothetical protein  32.74 
 
 
232 aa  121  1e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.654081 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0915  hypothetical protein  29.29 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.155446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1444  protein of unknown function DUF169  25.96 
 
 
281 aa  84.3  2e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2491  hypothetical protein  26.52 
 
 
296 aa  76.6  4e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2166  protein of unknown function DUF169  29.22 
 
 
281 aa  69.3  6e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0320  protein of unknown function DUF169  27.92 
 
 
284 aa  69.3  7e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.129666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2533  hypothetical protein  29.87 
 
 
285 aa  63.9  3e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>