More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2883 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  350  8e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  45.16 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  42.76 
 
 
274 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  42.27 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  33.59 
 
 
252 aa  73.9  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  37.1 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  36.44 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  32.67 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  36.51 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  33.94 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  42.22 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
221 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 
218 aa  63.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
223 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
227 aa  62.4  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  33.66 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  29.71 
 
 
170 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
226 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 
138 aa  61.6  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  36.54 
 
 
140 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  34.91 
 
 
221 aa  60.8  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  28.39 
 
 
145 aa  60.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
231 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
233 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  32.41 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  30.58 
 
 
377 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  34.75 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
222 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
223 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  31.76 
 
 
151 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  35.85 
 
 
133 aa  58.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2783  hypothetical protein  40.96 
 
 
93 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00810917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 
161 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 
221 aa  58.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 
132 aa  58.2  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 
128 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 
132 aa  57.8  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  36.54 
 
 
363 aa  57.8  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  33.33 
 
 
553 aa  57.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 
221 aa  57.8  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  34.62 
 
 
140 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 
135 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
140 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 
221 aa  57.4  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  39.76 
 
 
130 aa  57.4  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  34.62 
 
 
140 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
140 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
140 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  39.76 
 
 
130 aa  57.4  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  30.77 
 
 
198 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
227 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 
130 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
221 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  31.19 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  31.3 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
221 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  34.74 
 
 
380 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  32.04 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  28.07 
 
 
454 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  33.87 
 
 
140 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 
226 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  35.04 
 
 
223 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  31.39 
 
 
136 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1961  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 
244 aa  55.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 
147 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  36.26 
 
 
353 aa  55.1  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  31.09 
 
 
125 aa  55.1  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  33.71 
 
 
144 aa  54.7  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 
141 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.79 
 
 
393 aa  54.7  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.19 
 
 
148 aa  54.7  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  35.51 
 
 
113 aa  54.3  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 
406 aa  54.3  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
224 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
224 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 
269 aa  54.3  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1353  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 
177 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192542  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
224 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  28.44 
 
 
170 aa  54.3  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
224 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13503  Rhodanese-related sulfurtransferase  34.78 
 
 
129 aa  54.3  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.258058  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 
308 aa  54.3  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
230 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
224 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  37.65 
 
 
361 aa  54.3  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  27.4 
 
 
146 aa  54.3  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 
144 aa  53.9  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.03 
 
 
104 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.14 
 
 
104 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.14 
 
 
104 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.14 
 
 
104 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
252 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>