More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2745 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
425 aa  879  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  63.33 
 
 
423 aa  544  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  63.79 
 
 
423 aa  534  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  59.95 
 
 
426 aa  521  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.08686e-07  hitchhiker  6.59657e-08 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  59.1 
 
 
424 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.07933e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  60.67 
 
 
422 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  60.91 
 
 
422 aa  515  1e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.36944e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  59.47 
 
 
424 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  57.18 
 
 
424 aa  511  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  60.91 
 
 
422 aa  512  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  60.67 
 
 
423 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 
424 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  57.41 
 
 
427 aa  510  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  58.99 
 
 
421 aa  506  1e-142  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  59.29 
 
 
425 aa  507  1e-142  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
424 aa  502  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.27784e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  58.27 
 
 
420 aa  501  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
424 aa  502  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
422 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
424 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.12252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
422 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55791e-12 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  57.28 
 
 
422 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
424 aa  501  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.83486e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
424 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.51386e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
424 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 
424 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.49119e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  58.03 
 
 
427 aa  501  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 
424 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
424 aa  500  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
424 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
427 aa  497  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  2.14163e-06 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
424 aa  497  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  57.31 
 
 
427 aa  492  1e-138  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  57.88 
 
 
432 aa  491  1e-138  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  55.4 
 
 
423 aa  492  1e-138  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  57.07 
 
 
423 aa  494  1e-138  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  56.9 
 
 
425 aa  493  1e-138  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  57.07 
 
 
427 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  55.4 
 
 
423 aa  491  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  55.66 
 
 
424 aa  488  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  57.28 
 
 
423 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  3.46844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  56.13 
 
 
423 aa  483  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  55.4 
 
 
422 aa  481  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  56.26 
 
 
425 aa  484  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  55.48 
 
 
425 aa  480  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
423 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
422 aa  479  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.1419e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  55.24 
 
 
425 aa  480  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
425 aa  474  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  58.96 
 
 
423 aa  475  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
427 aa  474  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  56.46 
 
 
417 aa  474  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  55.88 
 
 
424 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  54.92 
 
 
426 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  52.76 
 
 
428 aa  460  1e-128  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 
427 aa  454  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  54.67 
 
 
427 aa  453  1e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  53.08 
 
 
428 aa  453  1e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  51.04 
 
 
430 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  52.28 
 
 
428 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
427 aa  450  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  52.28 
 
 
428 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  53.5 
 
 
428 aa  450  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
425 aa  446  1e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  52.87 
 
 
425 aa  444  1e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
424 aa  447  1e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  54.04 
 
 
429 aa  445  1e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  52.24 
 
 
421 aa  442  1e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  51.04 
 
 
436 aa  443  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
428 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  2.0455e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  53.11 
 
 
425 aa  438  1e-122  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  53.65 
 
 
435 aa  438  1e-122  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
421 aa  440  1e-122  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  5.82933e-05 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
426 aa  439  1e-122  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
421 aa  440  1e-122  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  51.9 
 
 
428 aa  441  1e-122  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  51.9 
 
 
428 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.21115e-07  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
428 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
428 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
435 aa  437  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.7376e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
428 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
428 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
423 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  52.08 
 
 
432 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 
426 aa  438  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
428 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
434 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  51.52 
 
 
428 aa  435  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
427 aa  437  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  51.77 
 
 
426 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  51.18 
 
 
428 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.45216e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  50.83 
 
 
424 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
428 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 
427 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 
469 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
428 aa  431  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  4.82447e-06 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
427 aa  431  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  51.18 
 
 
428 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.08788e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3335  seryl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
444 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  51.55 
 
 
426 aa  431  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>