49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2727 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  56.76 
 
 		 588 aa  647    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  100 
 
 		 601 aa  1235    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  32.39 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  32.62 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  27.68 
 
 		 530 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  29.94 
 
 		 509 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  27.95 
 
 		 571 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  32.81 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  28.47 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  31.58 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  30.95 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  33.04 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  36.67 
 
 		 532 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  27.4 
 
 		 516 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  28.21 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  24.09 
 
 		 556 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  24.39 
 
 		 513 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  30.09 
 
 		 449 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  23.91 
 
 		 457 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  26.51 
 
 		 567 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  25 
 
 		 540 aa  51.2  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  28.81 
 
 		 562 aa  50.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  29.32 
 
 		 455 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  27.61 
 
 		 368 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  30.11 
 
 		 976 aa  49.3  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  26.32 
 
 		 440 aa  49.3  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  27.04 
 
 		 430 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  24.86 
 
 		 251 aa  48.9  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  29.52 
 
 		 399 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4743  hypothetical protein  26.09 
 
 		 478 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  25.64 
 
 		 484 aa  47.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  47  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  33.33 
 
 		 482 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  40 
 
 		 619 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  37.5 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  24.58 
 
 		 408 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  25.98 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  27.78 
 
 		 680 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  37.5 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  30.34 
 
 		 409 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  34.25 
 
 		 336 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  25.44 
 
 		 670 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  22.89 
 
 		 630 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  25.61 
 
 		 228 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  24.63 
 
 		 365 aa  44.3  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  28.21 
 
 		 416 aa  43.9  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  27.54 
 
 		 444 aa  43.9  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  24.63 
 
 		 423 aa  43.5  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  21.33 
 
 		 688 aa  43.5  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>