More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2716 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  89.15 
 
 		 212 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  25.67 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  28.07 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 385 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  30.85 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  26.79 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  32.56 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  37.65 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 188 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 188 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 247 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  39.22 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  35.37 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>