33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2715 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2715  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  989    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3239  hypothetical protein  39.38 
 
 		 363 aa  146  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0081017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1708  hypothetical protein  43.54 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0135  hypothetical protein  42.42 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6120  type II site-specific deoxyribonuclease (type II restriction enzyme) involved in resistance to copper (Cu(I)/Cu(II))  39.41 
 
 		 421 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.397571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2541  hypothetical protein  35.12 
 
 		 430 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0181708  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1486  hypothetical protein  30.51 
 
 		 420 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2432  hypothetical protein  33.76 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3271  hypothetical protein  38.75 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2679  hypothetical protein  36.47 
 
 		 420 aa  108  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.794848 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2577  hypothetical protein  37.35 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6658  hypothetical protein  36.81 
 
 		 416 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613149  normal  0.601016 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4827  hypothetical protein  39.53 
 
 		 438 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.202847  normal  0.0862783 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6905  hypothetical protein  38.36 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10031  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1009  hypothetical protein  37.65 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal  0.165518 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5341  hypothetical protein  36.9 
 
 		 421 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1724  hypothetical protein  36.9 
 
 		 421 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304081  normal  0.948453 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4564  hypothetical protein  37.8 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3075  hypothetical protein  41.22 
 
 		 414 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4599  hypothetical protein  39.08 
 
 		 438 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79809  normal  0.613428 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0742  hypothetical protein  37.2 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.138801  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4140  hypothetical protein  38.16 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.813287  normal  0.597426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4209  hypothetical protein  37.91 
 
 		 424 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1835  hypothetical protein  33.93 
 
 		 440 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217821  hitchhiker  0.00106364 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5105  hypothetical protein  34.52 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2312  hypothetical protein  36.36 
 
 		 426 aa  93.6  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.951883 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0726  Type II site-specific deoxyribonuclease  31.79 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000123282  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  27.2 
 
 		 938 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  26.22 
 
 		 914 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0100  hypothetical protein  26.39 
 
 		 243 aa  56.6  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  6.44267e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.73 
 
 		 585 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  22.73 
 
 		 722 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0635  hypothetical protein  22.29 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>