More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2697 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  100 
 
 
162 aa  326  8e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  59.86 
 
 
153 aa  185  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  57.14 
 
 
161 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  58.74 
 
 
152 aa  184  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  59.03 
 
 
155 aa  183  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  57.75 
 
 
172 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  57.04 
 
 
159 aa  179  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  58.27 
 
 
157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  52.38 
 
 
160 aa  177  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  54.73 
 
 
155 aa  177  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  57.75 
 
 
153 aa  177  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  55.48 
 
 
159 aa  177  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  53.79 
 
 
150 aa  176  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  52.67 
 
 
160 aa  175  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  174  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  174  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  174  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  174  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  174  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  55.48 
 
 
151 aa  174  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  174  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
155 aa  174  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  53.52 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  54.23 
 
 
155 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  53.52 
 
 
160 aa  172  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  54.61 
 
 
154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  54.23 
 
 
155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  52.05 
 
 
152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  51.3 
 
 
162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  55.48 
 
 
160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  54 
 
 
159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  54.61 
 
 
155 aa  171  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  49.66 
 
 
157 aa  170  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  48.3 
 
 
158 aa  170  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  54.23 
 
 
155 aa  170  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  52.82 
 
 
159 aa  169  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  53.33 
 
 
159 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  55.94 
 
 
150 aa  168  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  53.47 
 
 
161 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  52 
 
 
155 aa  166  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  55 
 
 
167 aa  166  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  51.03 
 
 
161 aa  166  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  53.52 
 
 
156 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  52.45 
 
 
157 aa  166  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  55.78 
 
 
151 aa  166  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  51.33 
 
 
158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  48.3 
 
 
154 aa  164  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  47.33 
 
 
159 aa  164  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  53.42 
 
 
152 aa  164  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  51.68 
 
 
150 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  51.68 
 
 
150 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  45.58 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  52.82 
 
 
161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  51.7 
 
 
154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  51.06 
 
 
177 aa  160  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  51.39 
 
 
156 aa  160  8.000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  50 
 
 
156 aa  160  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  50 
 
 
156 aa  160  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
154 aa  159  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  52.86 
 
 
158 aa  159  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
154 aa  159  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  51.08 
 
 
154 aa  159  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  47.3 
 
 
158 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  47.06 
 
 
158 aa  158  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  52.35 
 
 
154 aa  158  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  50 
 
 
155 aa  158  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  51.35 
 
 
154 aa  157  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  58.27 
 
 
159 aa  157  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  52.9 
 
 
151 aa  157  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  48.63 
 
 
158 aa  157  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  50.35 
 
 
176 aa  157  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  50.35 
 
 
167 aa  157  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  50.36 
 
 
172 aa  156  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  48.63 
 
 
155 aa  156  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  49.66 
 
 
155 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  48.94 
 
 
168 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  48.94 
 
 
168 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  48.94 
 
 
168 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  48.23 
 
 
165 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  50.36 
 
 
182 aa  155  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  49.32 
 
 
156 aa  155  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  48.98 
 
 
157 aa  154  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  47.26 
 
 
147 aa  154  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  49.66 
 
 
157 aa  154  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  46.67 
 
 
156 aa  154  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  52.38 
 
 
154 aa  154  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2014  SsrA-binding protein  51.41 
 
 
151 aa  154  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.960885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
177 aa  153  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  50 
 
 
159 aa  154  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  52.21 
 
 
161 aa  153  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  47.86 
 
 
165 aa  153  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  49.29 
 
 
159 aa  152  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1996  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
175 aa  152  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0867  SsrA-binding protein  49.66 
 
 
176 aa  153  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.609087  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  48.32 
 
 
157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5790  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
158 aa  151  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.84107  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  48.94 
 
 
160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  53.44 
 
 
153 aa  150  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>