More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2675 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  100 
 
 		 249 aa  513  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  47.11 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  47.09 
 
 		 246 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  44.25 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  44.17 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  44.58 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  42.31 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  44.08 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  43.39 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  44.13 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  42.5 
 
 		 257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  44.39 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  39.39 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  40.2 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  39.62 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  38.38 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  38.05 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  38.72 
 
 		 323 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  38.57 
 
 		 270 aa  139  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  36.27 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  41.12 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  38.89 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  34.8 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  40.34 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  40.39 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  45.34 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  40.61 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  40.48 
 
 		 239 aa  138  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  38.62 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  36.92 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  34.31 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  36.95 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  33.81 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  37.39 
 
 		 297 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  43.55 
 
 		 286 aa  131  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  34.15 
 
 		 277 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  34.63 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  40 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  34.63 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  34.63 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  36.51 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  36.77 
 
 		 311 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  34.15 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  34.15 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  34.52 
 
 		 310 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  35.38 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  32.47 
 
 		 332 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  41.08 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  34.15 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  33.66 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  35.61 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  35.89 
 
 		 322 aa  126  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  37.5 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  45.65 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  45.65 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  35.12 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  45.65 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  35.29 
 
 		 333 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  45.65 
 
 		 230 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  45.65 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  45.65 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  45.65 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  45.65 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  33.83 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  32.58 
 
 		 270 aa  123  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  48.51 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  58.25 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  46.5 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  36.45 
 
 		 275 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  36.45 
 
 		 275 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  36.45 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  33.46 
 
 		 333 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  31.75 
 
 		 265 aa  121  8e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  31.75 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  59.38 
 
 		 165 aa  121  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  46.53 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  46.92 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  50.88 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  47.01 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  59.57 
 
 		 360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  59.57 
 
 		 360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  51.16 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  50.89 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  42.68 
 
 		 163 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  56.25 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  59.78 
 
 		 367 aa  119  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  60.22 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  46.27 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  52.21 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  61.7 
 
 		 227 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  52.21 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  53.1 
 
 		 423 aa  119  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  60.4 
 
 		 139 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  50.88 
 
 		 186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  51.35 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 358 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 471 aa  115  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 124 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>