More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2645 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  100 
 
 
150 aa  304  2e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  51.01 
 
 
141 aa  150  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  46.85 
 
 
141 aa  139  1e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  61.62 
 
 
107 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  7.62931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  55.77 
 
 
115 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  59.22 
 
 
107 aa  135  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  59.22 
 
 
107 aa  135  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  48.2 
 
 
141 aa  134  3e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  58.25 
 
 
107 aa  133  9e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.30429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  41.78 
 
 
165 aa  131  4e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  54.55 
 
 
107 aa  129  1e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  55.67 
 
 
107 aa  129  1e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  129  1e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  128  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  53.54 
 
 
107 aa  128  2e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  129  2e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  129  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  56.31 
 
 
108 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  128  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  128  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  54.37 
 
 
108 aa  127  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  56.31 
 
 
110 aa  126  9e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  126  9e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  126  9e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  55.67 
 
 
110 aa  126  1e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  126  1e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  51.43 
 
 
148 aa  125  2e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  54.05 
 
 
259 aa  125  2e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  55.21 
 
 
110 aa  125  2e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  57.89 
 
 
108 aa  125  2e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.55412e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4096  thioredoxin domain-containing protein  40.67 
 
 
150 aa  125  2e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.461798  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  51.4 
 
 
124 aa  124  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  50 
 
 
123 aa  124  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  54.17 
 
 
107 aa  124  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  125  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  51.49 
 
 
109 aa  124  4e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  124  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  54.74 
 
 
106 aa  124  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  56.31 
 
 
110 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  52.58 
 
 
103 aa  124  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  55.79 
 
 
108 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  51.92 
 
 
108 aa  124  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  50.49 
 
 
107 aa  124  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  54.84 
 
 
106 aa  123  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  52.78 
 
 
109 aa  124  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  46.15 
 
 
257 aa  123  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  56.04 
 
 
108 aa  123  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  53.85 
 
 
110 aa  123  8e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  50.98 
 
 
125 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  52.43 
 
 
109 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  50.49 
 
 
105 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  57.45 
 
 
110 aa  122  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  122  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  55 
 
 
108 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  8.76713e-08  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  51.92 
 
 
109 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  46.6 
 
 
108 aa  122  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  53.47 
 
 
108 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  52.63 
 
 
107 aa  121  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  5.34537e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  8.66569e-05 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  48.54 
 
 
108 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  51.46 
 
 
108 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  40.85 
 
 
141 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.94835e-07 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  53.47 
 
 
106 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  46.6 
 
 
109 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  4.29326e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  50.49 
 
 
106 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  54.9 
 
 
109 aa  121  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  53.12 
 
 
109 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  52.48 
 
 
108 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  58.51 
 
 
259 aa  121  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  51.52 
 
 
108 aa  121  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  57.78 
 
 
108 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  54.84 
 
 
108 aa  121  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  51.46 
 
 
108 aa  120  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  43.66 
 
 
149 aa  120  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  51.49 
 
 
106 aa  120  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  49.51 
 
 
108 aa  120  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  52.48 
 
 
106 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  52.48 
 
 
106 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  52.48 
 
 
119 aa  120  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  52 
 
 
109 aa  120  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  51.52 
 
 
108 aa  120  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  7.24164e-05 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  48.04 
 
 
109 aa  120  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  52.88 
 
 
107 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>