More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2632 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2632  ABC transporter-related protein  100 
 
 
357 aa  726    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.014615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  46.69 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0527  ABC transporter related  42.77 
 
 
348 aa  255  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  37.97 
 
 
347 aa  242  7e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  40.41 
 
 
349 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  37.64 
 
 
351 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  40.51 
 
 
355 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  44.11 
 
 
352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  36.36 
 
 
348 aa  216  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.56 
 
 
357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  40.26 
 
 
335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.83 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  36.56 
 
 
357 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  38.48 
 
 
374 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  35.31 
 
 
353 aa  212  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0642  ABC transporter related protein  45.09 
 
 
342 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  43.28 
 
 
352 aa  211  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  45.17 
 
 
405 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  40.27 
 
 
347 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2267  ABC transporter related protein  45.04 
 
 
351 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 
359 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4040  ABC transporter related  37.31 
 
 
365 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  36.14 
 
 
356 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  37.7 
 
 
386 aa  208  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  37.8 
 
 
343 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.28 
 
 
354 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.1 
 
 
368 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.47 
 
 
371 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  42.26 
 
 
352 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  42.22 
 
 
632 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  41.82 
 
 
348 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 
374 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  37.34 
 
 
363 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 
334 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  34.55 
 
 
353 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6582  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.28 
 
 
360 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3645  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.44 
 
 
342 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  35.45 
 
 
353 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 
377 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.69 
 
 
370 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  37.34 
 
 
363 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  40.18 
 
 
364 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2057  ABC transporter related protein  45 
 
 
327 aa  204  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0901178  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3161  ABC transporter related  38.33 
 
 
329 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0305522 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  35.51 
 
 
372 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.9 
 
 
353 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  38.33 
 
 
329 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  37.87 
 
 
353 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  38.91 
 
 
364 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.14 
 
 
371 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.25 
 
 
352 aa  203  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.07 
 
 
423 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.23 
 
 
345 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2834  ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 
342 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.05 
 
 
355 aa  202  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  37.58 
 
 
355 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.85 
 
 
353 aa  202  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.47 
 
 
384 aa  202  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  38.86 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  36.56 
 
 
372 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0285  ABC transporter related  37.77 
 
 
334 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0897858  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.07 
 
 
373 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1829  ABC transporter related  38.11 
 
 
328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.853496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.84314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  42.32 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.93 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000472739  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 
347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  38.58 
 
 
353 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  36.56 
 
 
372 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.93 
 
 
378 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  36.59 
 
 
373 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  34.85 
 
 
353 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.91 
 
 
345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 
355 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 
355 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  38.33 
 
 
354 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.87 
 
 
388 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 
355 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 
355 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  36.29 
 
 
347 aa  199  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  40.53 
 
 
346 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 
355 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  40.53 
 
 
346 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.34 
 
 
447 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 
355 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  37.63 
 
 
363 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  40.53 
 
 
346 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.87 
 
 
388 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.87 
 
 
388 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.74 
 
 
357 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  40.13 
 
 
343 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1205  ABC transporter related  39.12 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226177  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  39.62 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.88 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.56 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  39.62 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  38.11 
 
 
348 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  44.14 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1511  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  37.2 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280689  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.63 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>