216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2613 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  100 
 
 
191 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  66.49 
 
 
191 aa  267  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  64.92 
 
 
191 aa  265  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  67.02 
 
 
191 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  64.89 
 
 
190 aa  260  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  65.78 
 
 
192 aa  260  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  65.43 
 
 
190 aa  258  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  62.3 
 
 
191 aa  254  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  63.83 
 
 
190 aa  253  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  60.21 
 
 
191 aa  252  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  59.16 
 
 
191 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  58.12 
 
 
191 aa  239  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  63.64 
 
 
192 aa  236  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  56.38 
 
 
190 aa  229  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  57.07 
 
 
191 aa  226  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  56.91 
 
 
192 aa  226  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  55.5 
 
 
191 aa  224  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  52.88 
 
 
191 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  51.79 
 
 
196 aa  207  7e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  51.85 
 
 
190 aa  205  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  52.38 
 
 
190 aa  203  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  52.13 
 
 
188 aa  202  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  50.27 
 
 
191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  51.6 
 
 
192 aa  198  5e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  47 
 
 
197 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  52.66 
 
 
179 aa  192  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  49.21 
 
 
191 aa  191  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  48.21 
 
 
195 aa  187  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  50.79 
 
 
178 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  46.67 
 
 
195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  45.26 
 
 
191 aa  182  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  46.07 
 
 
180 aa  178  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  47.64 
 
 
178 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  43.98 
 
 
179 aa  174  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  47.87 
 
 
177 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  43.46 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  44.97 
 
 
179 aa  167  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  45.55 
 
 
178 aa  167  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  45.03 
 
 
178 aa  167  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  44.68 
 
 
179 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  44.97 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  43.75 
 
 
194 aa  161  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  43.23 
 
 
194 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  42.33 
 
 
179 aa  159  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  42.93 
 
 
179 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  42.93 
 
 
179 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  44.62 
 
 
178 aa  156  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  42.78 
 
 
196 aa  155  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  41.75 
 
 
194 aa  155  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  40.43 
 
 
233 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  39.9 
 
 
195 aa  154  9e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  40.74 
 
 
696 aa  151  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  41.49 
 
 
696 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  41.76 
 
 
181 aa  149  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  40.64 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  41.8 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  41.8 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  40.62 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  43.81 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  40.96 
 
 
177 aa  140  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  40.96 
 
 
392 aa  140  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  42.86 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  42.86 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  42.86 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  42.08 
 
 
215 aa  132  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  41.99 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  41.21 
 
 
215 aa  129  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  37.37 
 
 
214 aa  122  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  42.65 
 
 
140 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  39.86 
 
 
139 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  33.91 
 
 
165 aa  98.6  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  37.41 
 
 
146 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  40 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  31.87 
 
 
172 aa  95.9  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  39.44 
 
 
139 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  39.44 
 
 
139 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  39.44 
 
 
139 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  41.18 
 
 
146 aa  95.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  33.14 
 
 
164 aa  94.7  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  39.71 
 
 
140 aa  94.4  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  38.81 
 
 
139 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  38.97 
 
 
140 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  38.24 
 
 
140 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  40 
 
 
140 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  40 
 
 
140 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  40 
 
 
140 aa  92.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  40 
 
 
140 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  40 
 
 
140 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  40 
 
 
140 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  40 
 
 
140 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  40 
 
 
140 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  34.22 
 
 
202 aa  91.7  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  34.06 
 
 
143 aa  91.7  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  37.76 
 
 
140 aa  91.7  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  33.33 
 
 
263 aa  91.3  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  38.97 
 
 
140 aa  90.9  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  38.81 
 
 
139 aa  91.3  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  38.97 
 
 
140 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  35.29 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  35.67 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>