More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2600 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
345 aa  706  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 
318 aa  125  8e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 
324 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 
344 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 
354 aa  110  4e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 
324 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.97877e-05 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  27.79 
 
 
334 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 
334 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  27.11 
 
 
327 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 
334 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 
331 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.88 
 
 
346 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 
334 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 
310 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 
324 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  25.46 
 
 
355 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 
366 aa  99.4  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  27.25 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  26.35 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  2.71524e-08  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  27.09 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  28.98 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 
320 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  25.15 
 
 
323 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  27.27 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  25.95 
 
 
329 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  27.41 
 
 
335 aa  86.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 
323 aa  85.9  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 
324 aa  85.9  1e-15  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 
317 aa  85.5  1e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 
346 aa  84.7  2e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  26.16 
 
 
317 aa  85.1  2e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  25.66 
 
 
328 aa  85.1  2e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 
329 aa  84  3e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  27.21 
 
 
317 aa  84.3  3e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  26.55 
 
 
317 aa  83.2  5e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 
325 aa  83.2  6e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  26.55 
 
 
317 aa  82.8  7e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  27.21 
 
 
317 aa  83.2  7e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  27.21 
 
 
317 aa  83.2  7e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 
352 aa  82.8  8e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 
317 aa  81.6  2e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 
322 aa  80.9  3e-14  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  22.49 
 
 
351 aa  79.7  6e-14  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  26.85 
 
 
314 aa  79.7  7e-14  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 
307 aa  79.3  8e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 
321 aa  79  1e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 
328 aa  78.2  2e-13  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 
340 aa  77.8  2e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  26.42 
 
 
277 aa  77.8  3e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  25.65 
 
 
342 aa  77.4  3e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  25.61 
 
 
348 aa  76.6  6e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  24.2 
 
 
337 aa  75.5  1e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 
315 aa  74.3  2e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  27.16 
 
 
362 aa  74.3  3e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 
348 aa  73.6  5e-12  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  25.39 
 
 
343 aa  73.6  5e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  24.07 
 
 
359 aa  73.2  6e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0337  beta-lactamase domain-containing protein  24.76 
 
 
336 aa  72.8  7e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 
322 aa  72.8  8e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  23.11 
 
 
324 aa  72  1e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  25.18 
 
 
332 aa  71.6  2e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  24.56 
 
 
352 aa  70.9  3e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  23.71 
 
 
325 aa  70.5  4e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  24.92 
 
 
321 aa  70.5  4e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  25.24 
 
 
297 aa  70.9  4e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  24.57 
 
 
357 aa  70.1  5e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  24.77 
 
 
348 aa  70.1  6e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  22.61 
 
 
286 aa  70.1  6e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  24.34 
 
 
302 aa  69.7  7e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  22.84 
 
 
368 aa  68.9  1e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 
359 aa  68.9  1e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  25.53 
 
 
324 aa  68.9  1e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  23.46 
 
 
369 aa  68.9  1e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.88 
 
 
357 aa  68.9  1e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  27.88 
 
 
374 aa  68.9  1e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  23.55 
 
 
359 aa  68.9  1e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  26.05 
 
 
353 aa  68.6  2e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 
365 aa  68.2  2e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  23.85 
 
 
359 aa  67.4  3e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 
330 aa  67  4e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 
862 aa  67  4e-10  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  26.1 
 
 
357 aa  67  4e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 
335 aa  67.4  4e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 
308 aa  67  4e-10  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  24.48 
 
 
310 aa  66.2  7e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 
310 aa  66.2  7e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  23.56 
 
 
359 aa  66.2  8e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  28.43 
 
 
295 aa  66.2  8e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  24.75 
 
 
331 aa  65.9  1e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0062  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 
336 aa  65.9  1e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 
310 aa  64.7  2e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  24.54 
 
 
354 aa  65.1  2e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  23.44 
 
 
354 aa  64.7  2e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.72 
 
 
354 aa  63.9  4e-09  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  30.77 
 
 
306 aa  63.5  5e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 
279 aa  63.2  7e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 
337 aa  63.2  7e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4168  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 
318 aa  62  2e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 
282 aa  61.2  2e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>