48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2546 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  463  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  43.96 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  42 
 
 		 178 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  42.78 
 
 		 179 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  42.16 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  43.48 
 
 		 184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  42.65 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  35.76 
 
 		 216 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  34.53 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  32.62 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  29.86 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  29.86 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  29.86 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  34.11 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  29.5 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  32.89 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  27.59 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  35.07 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  33.63 
 
 		 425 aa  75.1  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  30.67 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  34.25 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  27.22 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  27.32 
 
 		 435 aa  72.8  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  30.99 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  37.86 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  35.09 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  38.61 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  38.61 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  38.61 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  34.33 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  26 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  32.82 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  26.6 
 
 		 444 aa  68.6  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  32.84 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  35.11 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  31.78 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  29.46 
 
 		 427 aa  67  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  26.53 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  33.33 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  32.84 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  35.92 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  38.38 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  31.71 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  28.26 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  25.4 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  26.51 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  26.18 
 
 		 416 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  25.26 
 
 		 400 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>