208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2520 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
232 aa  474  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.21 
 
 
228 aa  202  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.98 
 
 
259 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.96 
 
 
258 aa  162  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.44 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  41.3 
 
 
273 aa  158  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.23 
 
 
250 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.71 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.73 
 
 
269 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.29 
 
 
258 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.18 
 
 
278 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.29 
 
 
269 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.84 
 
 
263 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.84 
 
 
263 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40 
 
 
287 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  40.97 
 
 
338 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  41.07 
 
 
338 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.82 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40.97 
 
 
1153 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.56 
 
 
299 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.24 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.36 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.24 
 
 
285 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.24 
 
 
271 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.81 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  40.43 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.43 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  37.55 
 
 
277 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.33 
 
 
240 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.98 
 
 
243 aa  123  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.56 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.96 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 
233 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.75 
 
 
245 aa  118  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.26 
 
 
260 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.68 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.07 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.92 
 
 
265 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.77 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.92 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.38 
 
 
257 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.63 
 
 
328 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.8 
 
 
283 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  33.47 
 
 
245 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.04 
 
 
808 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.63 
 
 
328 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.86 
 
 
231 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.06 
 
 
255 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.06 
 
 
255 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.22 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.22 
 
 
261 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 
252 aa  95.9  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.29 
 
 
257 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.33 
 
 
260 aa  94.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.08 
 
 
242 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.62 
 
 
282 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.25 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.74 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.75 
 
 
245 aa  89.7  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  31.6 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.6 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.9 
 
 
279 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.6 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  31.6 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.49 
 
 
250 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.6 
 
 
253 aa  89  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32 
 
 
253 aa  89  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.6 
 
 
253 aa  89  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.36 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2562  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.84 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.04 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.2 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
259 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1281  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.11 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.92 
 
 
246 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 
243 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.69 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.85 
 
 
246 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.33 
 
 
837 aa  85.5  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0908  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.2 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0876  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.2 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  31.51 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.2 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00426171  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0848  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.2 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  31.69 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0961  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.2 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  30.17 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  30.17 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.86 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.09 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.86 
 
 
279 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.07 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.17 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.07 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>