More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2517 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
260 aa  524  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  55.6 
 
 
267 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  54.86 
 
 
267 aa  272  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  57.42 
 
 
264 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  52.76 
 
 
264 aa  270  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  52.76 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  52.34 
 
 
270 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
272 aa  261  6.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  56.42 
 
 
260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  53.91 
 
 
262 aa  258  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  53.12 
 
 
285 aa  239  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  51.76 
 
 
263 aa  238  9e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 
266 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  52.76 
 
 
283 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
436 aa  235  5.0000000000000005e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  49.01 
 
 
268 aa  231  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  46.25 
 
 
270 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  46.49 
 
 
290 aa  229  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  46.25 
 
 
270 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 
260 aa  227  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
288 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 
266 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  45.06 
 
 
270 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  51.33 
 
 
268 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  50.59 
 
 
267 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
264 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  47.35 
 
 
288 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  47.35 
 
 
288 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 
270 aa  223  2e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 
270 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  46.25 
 
 
271 aa  222  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
449 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  42.25 
 
 
262 aa  221  6e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
490 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
268 aa  218  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
271 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
269 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 
266 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  48.25 
 
 
270 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  47.84 
 
 
497 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 
265 aa  216  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 
266 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  44.92 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 
269 aa  215  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  51.76 
 
 
266 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 
272 aa  214  8e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  43.46 
 
 
450 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  46.9 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
270 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
270 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
270 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
270 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
270 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  46.34 
 
 
297 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 
270 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 
270 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
273 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 
444 aa  210  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  45.24 
 
 
264 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
263 aa  210  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  47.06 
 
 
270 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 
283 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 
264 aa  208  7e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 
268 aa  207  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  48.25 
 
 
261 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
271 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
267 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 
274 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  43.63 
 
 
274 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  43.63 
 
 
274 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  43.63 
 
 
274 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  43.63 
 
 
274 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  43.63 
 
 
274 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  43.63 
 
 
274 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
308 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  43.63 
 
 
274 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 
268 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  42.86 
 
 
273 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  43.63 
 
 
274 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 
261 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  43.63 
 
 
274 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  43.63 
 
 
274 aa  205  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 
280 aa  205  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  47.86 
 
 
261 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  49.38 
 
 
269 aa  204  9e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
266 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
266 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
266 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
266 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 
275 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
266 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 
278 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
266 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  44.14 
 
 
449 aa  203  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>