260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2514 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
196 aa  411  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.22 
 
 
194 aa  262  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.57 
 
 
190 aa  258  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.7 
 
 
191 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.9 
 
 
202 aa  256  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.04 
 
 
191 aa  255  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.29 
 
 
191 aa  254  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  58.82 
 
 
212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.82 
 
 
204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.57 
 
 
191 aa  252  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.28 
 
 
190 aa  248  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.75 
 
 
193 aa  248  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.63 
 
 
192 aa  243  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.01 
 
 
183 aa  242  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  62.01 
 
 
190 aa  241  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.38 
 
 
199 aa  240  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60 
 
 
198 aa  239  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.02 
 
 
188 aa  237  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.02 
 
 
188 aa  237  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  58.29 
 
 
189 aa  237  8e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.6 
 
 
198 aa  236  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.47 
 
 
202 aa  235  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.04 
 
 
194 aa  234  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0678  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.85 
 
 
189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000050702 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  57.22 
 
 
190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.3 
 
 
210 aa  232  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.75 
 
 
186 aa  231  6e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.55 
 
 
208 aa  229  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  56.67 
 
 
190 aa  230  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.14 
 
 
207 aa  229  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.43 
 
 
187 aa  230  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.38 
 
 
200 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.3 
 
 
197 aa  229  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1933  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.4 
 
 
193 aa  229  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.99 
 
 
217 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.89 
 
 
208 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.33 
 
 
200 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.33 
 
 
200 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.33 
 
 
200 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.38 
 
 
196 aa  228  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.78 
 
 
200 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.33 
 
 
200 aa  227  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0057  methyladenine glycosylase  52.97 
 
 
196 aa  227  8e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2291  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.24 
 
 
186 aa  225  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.69 
 
 
217 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.34 
 
 
220 aa  224  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.33 
 
 
201 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.33 
 
 
201 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.89 
 
 
214 aa  223  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.69 
 
 
208 aa  222  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.12 
 
 
218 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.18 
 
 
186 aa  221  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.06 
 
 
186 aa  221  8e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.51 
 
 
193 aa  218  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.28 
 
 
198 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 
198 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.93 
 
 
208 aa  217  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.51 
 
 
193 aa  217  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.56 
 
 
198 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.51 
 
 
193 aa  217  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  58.1 
 
 
202 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.55 
 
 
191 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.51 
 
 
193 aa  217  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.1 
 
 
202 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.08 
 
 
189 aa  217  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  58.1 
 
 
202 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  58.1 
 
 
202 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.07 
 
 
190 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 
187 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.96 
 
 
193 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  57.54 
 
 
202 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.01 
 
 
191 aa  215  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.24 
 
 
187 aa  215  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  57.54 
 
 
202 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  57.54 
 
 
202 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  57.54 
 
 
202 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.55 
 
 
191 aa  214  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.69 
 
 
195 aa  214  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.01 
 
 
190 aa  214  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.7 
 
 
198 aa  214  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.65 
 
 
194 aa  214  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.49 
 
 
187 aa  214  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.91 
 
 
200 aa  214  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.51 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.85 
 
 
198 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.46 
 
 
200 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.91 
 
 
200 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0857  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.89 
 
 
198 aa  213  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.671236  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  51.93 
 
 
187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  51.93 
 
 
187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.91 
 
 
198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  55 
 
 
189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.55 
 
 
196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.51 
 
 
190 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.93 
 
 
187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55 
 
 
194 aa  211  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.93 
 
 
187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.93 
 
 
187 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.93 
 
 
187 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.93 
 
 
187 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>