More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2500 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
380 aa  781    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  51.32 
 
 
379 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
379 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
379 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31540  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.02 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.430124  hitchhiker  0.000095284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2684  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.29 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126402  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0096  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  52.01 
 
 
378 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0160842  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.55 
 
 
375 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50 
 
 
379 aa  396  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.19 
 
 
379 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.85 
 
 
382 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.74 
 
 
375 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  53.08 
 
 
375 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.32 
 
 
379 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.74 
 
 
379 aa  389  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.26 
 
 
380 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.81 
 
 
375 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.33 
 
 
375 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2192  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.59 
 
 
380 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  52.82 
 
 
375 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.68 
 
 
380 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2281  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.32 
 
 
380 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.07 
 
 
377 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.6 
 
 
375 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.87 
 
 
375 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.87 
 
 
375 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3106  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.08 
 
 
375 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.332334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  49.46 
 
 
375 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
379 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.79 
 
 
389 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1665  butyryl-CoA dehydrogenase  51.32 
 
 
380 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  49.74 
 
 
379 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2906  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.35 
 
 
375 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.26 
 
 
379 aa  385  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  49.6 
 
 
379 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.6 
 
 
379 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  50.26 
 
 
379 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.08 
 
 
380 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  49.6 
 
 
379 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  49.6 
 
 
379 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  49.6 
 
 
379 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  49.6 
 
 
379 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2548  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.35 
 
 
375 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  49.6 
 
 
379 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  48.94 
 
 
380 aa  375  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  49.6 
 
 
379 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  49.6 
 
 
379 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.99 
 
 
376 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.672922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2436  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.8 
 
 
383 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4666  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.08 
 
 
375 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3106  acyl-CoA dehydrogenase-like  53.08 
 
 
375 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.6 
 
 
379 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.94 
 
 
380 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3492  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.53 
 
 
383 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  49.07 
 
 
376 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  49.07 
 
 
376 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  49.07 
 
 
376 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
376 aa  368  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  50.13 
 
 
377 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  49.07 
 
 
376 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  49.07 
 
 
376 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.4 
 
 
376 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4257  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.45 
 
 
376 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2279  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.53 
 
 
383 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  49.07 
 
 
381 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.88 
 
 
380 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3936  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.93 
 
 
376 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132156  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.34 
 
 
390 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2826  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.87 
 
 
385 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1386  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.61 
 
 
385 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.47 
 
 
377 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2865  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.68 
 
 
383 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509295  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2885  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.53 
 
 
383 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.67 
 
 
377 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.34 
 
 
386 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1084  butyryl-CoA dehydrogenase  50.67 
 
 
377 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.87 
 
 
377 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.81 
 
 
379 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.81 
 
 
376 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  48.54 
 
 
381 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.47 
 
 
379 aa  365  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.81 
 
 
380 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3036  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.96 
 
 
385 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.07 
 
 
379 aa  363  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000229425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.54 
 
 
376 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50 
 
 
377 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.94 
 
 
377 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00118834  normal  0.0149252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.21 
 
 
379 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.21 
 
 
377 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  46.83 
 
 
380 aa  362  5.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3404  acyl-CoA dehydrogenase-like  50.94 
 
 
377 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4963  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.94 
 
 
377 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  50.4 
 
 
377 aa  362  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.21 
 
 
377 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
378 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.77 
 
 
379 aa  362  9e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1710  Acyl-CoA dehydrogenase-like  49.87 
 
 
386 aa  361  9e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.67 
 
 
377 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.67 
 
 
377 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>