More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2493 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  100 
 
 
397 aa  816    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  57.83 
 
 
396 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  57.29 
 
 
399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  57.43 
 
 
397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  58.95 
 
 
396 aa  465  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  57.18 
 
 
397 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  56.28 
 
 
399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  55.56 
 
 
398 aa  448  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  54.04 
 
 
402 aa  444  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  53.69 
 
 
396 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  54.8 
 
 
396 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  55.16 
 
 
399 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  54.16 
 
 
400 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  52.88 
 
 
395 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  51.88 
 
 
395 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.32 
 
 
399 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  53.83 
 
 
394 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  52.51 
 
 
394 aa  420  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  48.74 
 
 
396 aa  412  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  51.38 
 
 
395 aa  411  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.06 
 
 
417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  54.19 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  52.36 
 
 
403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.68 
 
 
395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  51.17 
 
 
392 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  49.37 
 
 
396 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.74 
 
 
399 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  51.97 
 
 
391 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  49.23 
 
 
398 aa  392  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49 
 
 
400 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  48.83 
 
 
390 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.78 
 
 
394 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.19 
 
 
427 aa  386  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  47.39 
 
 
418 aa  381  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  47.95 
 
 
398 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  47.39 
 
 
418 aa  381  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  48.38 
 
 
426 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.35 
 
 
398 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  47.59 
 
 
397 aa  378  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
388 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  46.92 
 
 
398 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
388 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  47.99 
 
 
427 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.51 
 
 
413 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 
391 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  47.22 
 
 
423 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  49.34 
 
 
394 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.15 
 
 
387 aa  365  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  47.46 
 
 
422 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  48.05 
 
 
392 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  48.67 
 
 
398 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  47.49 
 
 
386 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  48.24 
 
 
418 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  45.97 
 
 
388 aa  362  8e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.46 
 
 
393 aa  361  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  49.07 
 
 
406 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  47.26 
 
 
385 aa  360  3e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.8 
 
 
406 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  46.8 
 
 
404 aa  358  7e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.06 
 
 
406 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1109  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.25 
 
 
411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  47.49 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1426  acetylornithine aminotransferase  44.39 
 
 
400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.8 
 
 
406 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  47.4 
 
 
404 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.1 
 
 
398 aa  355  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  45.62 
 
 
398 aa  354  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  45.62 
 
 
398 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  46.74 
 
 
385 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  46.95 
 
 
386 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.48 
 
 
406 aa  352  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.41 
 
 
405 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.49 
 
 
410 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  45.36 
 
 
398 aa  351  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  47.69 
 
 
414 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.41 
 
 
399 aa  348  7e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  44.99 
 
 
390 aa  348  7e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  46.55 
 
 
444 aa  348  9e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  44.91 
 
 
389 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  48.33 
 
 
403 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2878  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
401 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.675543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  47.47 
 
 
403 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  45.01 
 
 
405 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.78 
 
 
406 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2692  acetylornithine aminotransferase  49.61 
 
 
401 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  46.7 
 
 
410 aa  346  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.97 
 
 
408 aa  346  5e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  44.65 
 
 
389 aa  346  5e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
394 aa  345  5e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  44.78 
 
 
404 aa  345  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  44.53 
 
 
403 aa  346  5e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2785  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.61 
 
 
401 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  47.07 
 
 
402 aa  345  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1958  acetylornithine aminotransferase  43.26 
 
 
401 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  45.48 
 
 
402 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19841  acetylornithine aminotransferase  46.58 
 
 
418 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0786665 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.14 
 
 
387 aa  344  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  46.13 
 
 
403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.17 
 
 
409 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  48.67 
 
 
395 aa  343  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>