More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2484 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  100 
 
 		 313 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  39.71 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  38.04 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  40.32 
 
 		 305 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  38.3 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  37.79 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  38.71 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  38.71 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  36.36 
 
 		 299 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.93 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  32.11 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  36.64 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  36.75 
 
 		 305 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  34.55 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  31.56 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  37.13 
 
 		 334 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  32.64 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  30.67 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  32.39 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  35.81 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  46.36 
 
 		 450 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  33.61 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  32.13 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  45.45 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  33.9 
 
 		 327 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  31.42 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  34.62 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  33.33 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  32.35 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  32.61 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  33.61 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  33.46 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  49.28 
 
 		 455 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  47.37 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  33.47 
 
 		 459 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  49.21 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  47.3 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  48.55 
 
 		 453 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  33.88 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  32.34 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  51.91 
 
 		 455 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  38.65 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  48.55 
 
 		 456 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  39.13 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  33.75 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  30.77 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  32.8 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  43.14 
 
 		 384 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  43.42 
 
 		 445 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  41.06 
 
 		 423 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  49.14 
 
 		 411 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  43.42 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  33.06 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  43.05 
 
 		 247 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  51.22 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  38.64 
 
 		 387 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  47.83 
 
 		 459 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  44.59 
 
 		 524 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  36.79 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  50.4 
 
 		 376 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  38.16 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  31.58 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  47.15 
 
 		 374 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  49.57 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  30.96 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  30.96 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  31.47 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  30.96 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  39.64 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  47.66 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  32.65 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  30.96 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  48.23 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  32.79 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  26.02 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  47.18 
 
 		 440 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  44.22 
 
 		 460 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  45.59 
 
 		 460 aa  123  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  45.86 
 
 		 457 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  42 
 
 		 223 aa  123  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  39.75 
 
 		 325 aa  122  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  31.49 
 
 		 299 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  48.87 
 
 		 454 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  46.48 
 
 		 439 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.44 
 
 		 343 aa  122  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  30.42 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  31.03 
 
 		 282 aa  122  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  48.44 
 
 		 229 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  39.15 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1060  peptidase M23B  29.84 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  34.68 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  38.65 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  52.99 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  45.1 
 
 		 442 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  52.14 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  48.31 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  30.54 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  41.67 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  26.46 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  47.83 
 
 		 404 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>