More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2453 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 455 aa  925    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  49.66 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  49.01 
 
 		 443 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  48.67 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  48.07 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  48.76 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  46.8 
 
 		 450 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  46.53 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  45.61 
 
 		 438 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  46.41 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  46.95 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  45.6 
 
 		 441 aa  363  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  45.49 
 
 		 444 aa  362  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  45.75 
 
 		 443 aa  360  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  45.27 
 
 		 461 aa  355  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  49.19 
 
 		 481 aa  351  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  43.13 
 
 		 476 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  48.72 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  45.58 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  47.26 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  42.05 
 
 		 468 aa  345  8e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  45.77 
 
 		 456 aa  345  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  48.47 
 
 		 428 aa  345  8e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  48.54 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  49.86 
 
 		 468 aa  341  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  47.85 
 
 		 439 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  49.71 
 
 		 438 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  45.95 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  49.29 
 
 		 438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  49.29 
 
 		 438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  44.02 
 
 		 441 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  49 
 
 		 437 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  49.29 
 
 		 438 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  48.64 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  49.86 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  47.41 
 
 		 482 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  43.9 
 
 		 440 aa  332  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  47.41 
 
 		 482 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  49.43 
 
 		 439 aa  332  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  49.72 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  49.72 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  46.11 
 
 		 439 aa  330  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  47.73 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  45.32 
 
 		 458 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  48.1 
 
 		 451 aa  329  7e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  46.23 
 
 		 444 aa  328  9e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  47.55 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  47.01 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  44.29 
 
 		 456 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  44.47 
 
 		 457 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  41.65 
 
 		 432 aa  326  5e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  43.22 
 
 		 480 aa  326  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  48.9 
 
 		 445 aa  325  9e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  48.33 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  48.33 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  49 
 
 		 445 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  49.29 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  44.78 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  47.66 
 
 		 440 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  46.41 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  46.52 
 
 		 423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  46.94 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  46.56 
 
 		 428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  45.39 
 
 		 463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  44.63 
 
 		 483 aa  320  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  44.87 
 
 		 446 aa  318  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  45.74 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  45.74 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  43.8 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  42.07 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  46.73 
 
 		 447 aa  318  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  45.93 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  44.95 
 
 		 440 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  41.75 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  50.15 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  42.66 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  47.95 
 
 		 453 aa  315  8e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  45.36 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  42.66 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  45.09 
 
 		 515 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  41.28 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  43.46 
 
 		 522 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  43.77 
 
 		 478 aa  308  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  43.46 
 
 		 526 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  42.53 
 
 		 479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  47.22 
 
 		 444 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  44.51 
 
 		 410 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  41.63 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  42.26 
 
 		 515 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  44.33 
 
 		 515 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  44.33 
 
 		 515 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  44.33 
 
 		 515 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  46.54 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  46.87 
 
 		 521 aa  306  6e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  42.11 
 
 		 530 aa  306  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  41.46 
 
 		 478 aa  305  8.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  46.87 
 
 		 530 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  46.87 
 
 		 524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  46.87 
 
 		 524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  42.72 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>