299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2441 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2441  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 97 aa  191  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100189  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  56.25 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  54.55 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  56.25 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  62.16 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  57.14 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  52.63 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  46.32 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  51.95 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  57.53 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  48.24 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  51.76 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  44.21 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  54.79 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  49.33 
 
 		 111 aa  87.4  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  42.7 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  44.32 
 
 		 111 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  44.19 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  42.53 
 
 		 104 aa  86.7  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  42.7 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  42.7 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  44.32 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  49.35 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  48.28 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  48.28 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  48.65 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  44.19 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  42.05 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  47.06 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  44.33 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  54.17 
 
 		 111 aa  84.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  48.05 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  48.72 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  54.17 
 
 		 111 aa  84.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  44.33 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  44.19 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  46.75 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  47.13 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  48.05 
 
 		 110 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  41.3 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  45.88 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  45.35 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  42.05 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  48.19 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  45.45 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  54.67 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  41.57 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  48.68 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  45.78 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  50.67 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  48.78 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  42.27 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  44.87 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  46.58 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  48.65 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  48.68 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  42.7 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  37.5 
 
 		 168 aa  80.1  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  49.32 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  46.34 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  39.33 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  44.74 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  49.32 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  47.95 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  48.1 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  47.95 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  42.39 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  44.83 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  47.37 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  47.95 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  48.1 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  47.95 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  47.3 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  48.72 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  40.79 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1049  preprotein translocase subunit YajC  49.38 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  44 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  43.42 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  43.42 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  43.24 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  48.61 
 
 		 95 aa  76.6  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  46.84 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  45.21 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  45.21 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  44.87 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  45.21 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  40.66 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  45.07 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  41.24 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>