More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2334 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  100 
 
 		 587 aa  1202    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 576 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2268  histidine kinase  38.15 
 
 		 571 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467853  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 574 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.932152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1768  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 576 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 577 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0813  histidine kinase  34.94 
 
 		 587 aa  353  5e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 557 aa  333  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 566 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  34.17 
 
 		 591 aa  301  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  33.08 
 
 		 567 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  32.6 
 
 		 552 aa  292  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 565 aa  292  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 588 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1349  histidine kinase  34.88 
 
 		 554 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134136  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 607 aa  270  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1344  histidine kinase  29.23 
 
 		 576 aa  244  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2828  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 584 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  29.74 
 
 		 566 aa  229  8e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0696  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 570 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2036  histidine kinase  30.28 
 
 		 558 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2043  histidine kinase  30.6 
 
 		 560 aa  188  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  36.59 
 
 		 313 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 970 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 567 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  39.21 
 
 		 655 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  42.04 
 
 		 830 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.13 
 
 		 819 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  35.48 
 
 		 516 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  39.43 
 
 		 674 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 		 819 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 		 704 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  33.86 
 
 		 531 aa  158  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 656 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1360  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 403 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 542 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  36 
 
 		 656 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  39.41 
 
 		 912 aa  156  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 		 702 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 		 705 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  38.4 
 
 		 673 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  38.14 
 
 		 592 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 661 aa  154  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 595 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  39.66 
 
 		 542 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 714 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 510 aa  153  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.66 
 
 		 541 aa  153  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 619 aa  153  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 592 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 645 aa  153  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 662 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 570 aa  153  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 655 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 683 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  37.77 
 
 		 801 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 		 804 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0696  histidine kinase  37.14 
 
 		 248 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0073771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  35.39 
 
 		 621 aa  151  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 		 801 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 587 aa  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2844  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 550 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  34.82 
 
 		 490 aa  151  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 551 aa  151  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0403  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 374 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  36.44 
 
 		 661 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  34.78 
 
 		 483 aa  150  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  36.02 
 
 		 647 aa  150  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 584 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3364  histidine kinase  36.71 
 
 		 249 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 682 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  36.82 
 
 		 853 aa  148  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 		 670 aa  148  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 491 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  34.94 
 
 		 517 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  37.93 
 
 		 560 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.65 
 
 		 707 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 488 aa  147  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 844 aa  147  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  36.84 
 
 		 785 aa  147  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 392 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 544 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  37.86 
 
 		 548 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  36.48 
 
 		 1092 aa  146  9e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 671 aa  146  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  36.67 
 
 		 604 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  37.82 
 
 		 486 aa  146  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  36.21 
 
 		 248 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.19 
 
 		 744 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 630 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  34.58 
 
 		 695 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 641 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 751 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 514 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>